基因捕获技术的现状及应用.pdfVIP

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１４，３４（１２）：１０７１１１ ＤＯＩ：１０．１３５２３／ｊ．ｃｂ 檪檪檪檪檪檪檪檪殏 檪 殏 檪 综　　述檪 殏 檪 殏檪檪檪檪檪檪檪檪 基因捕获技术的现状及应用 １，２，３ ２ ２ ４ 王明科 　孙慧勤 　粟永萍 　邹仲敏 （１中国人民解放军海军医学研究所　上海　２００４３３） （２第三军医大学军事预防医学院全军复合伤研究所　创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室　重庆　４０００３８） （３解放军４４１医院　福鼎　３５５２００　４第三军医大学军事预防医学院毒理学研究所　重庆　４０００３８） 摘要　随着越来越多生物基因组测序的完成，生物医学研究已进入后基因组时代。基因捕获技 术由于其在克隆、发现新基因及揭示基因功能方面具有独特的优点，已成为功能基因组时代研究 的有力工具，在生物医学研究各个领域的应用日趋广泛。主要对基因捕获技术的原理、分类、一 般操作流程、优缺点及基因捕获在发育生物学、新基因鉴定、干细胞分化、肿瘤和生殖医学研究方 面的应用作一综述，为相关研究者提供借鉴。 关键词　基因捕获　发育生物学　新基因鉴定　干细胞分化　肿瘤 生殖医学 中图分类号　Ｑ７８９ 　　后基因组时代阐明基因的功能及不同基因之间的 主细胞基因组，形成内源基因和报告基因的融合转录 相互作用已成为生物医学研究的迫切任务。目前， 本，产生内源基因失活突变，通过报告基因的表达提示 ７０％以上的基因功能未知，而基因捕获（ｇｅｎｅｔｒａｐｐｉｎｇ） 插入突变的存在及突变内源基因的时空表达特点。 技术在揭示基因功能方面有独特的优点，在功能基因 １．２　基因捕获的基本分类 ［１］ ［３４］ 组时代可发挥重要作用 。此外，国际基因捕获协会 　　基因捕获载体包括３种基本类型 ：增强子捕获 （ＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌＧｅｎｅＴｒａｐＣｏｎｓｏｒｔｉｕｍ，ＩＧＴＣ）在其网站提 （ｅｎｈａｎｃｅｒｔｒａｐ）载体、启动子捕获（ｐｒｏｍｏｔｅｒｔｒａｐ）载体 供了大量的基因捕获胚胎干细胞（ｅｍｂｒｙｏｎｉｃｓｔｅｍｃｅｌｌｓ， 和基因捕获载体。增强子捕获载体插入位置常邻近编 ＥＳＣｓ），截至２０１４年１０月６日已包括１２５０２９个可免费 ［４］ 码序列 。启动子捕获载体只能用于单个细胞产生突 使用的基因捕获细胞系，为阐述基因功能提供了重要 变体，而不能使生物体发生突变，并具有 ＤＮＡ插入偏 ［２］ 研究平台 。本文主要对基因捕获的原理、分类、一般 ［５］ 向性，且只能捕获有转录活性的基因 。但启动子捕 操作流程、优缺点及在生物医学研究中的应用作一 获载体减少了非功能ＤＮＡ片段被捕获进入ＥＳＣｓ而造 介绍。 ［６］ 成假像的机率 ，也可鉴定冗余基因和在多个发育阶 １　基因捕获原理及分类 段行使功能的基因。基因捕获载体常用来研究小鼠体 内插入导致的突变，也可发现和确定机体发生发展过 １．１　基因捕获的基本原理