第五章rna的生物合成已完成.ppt

第五章 RNA的生物合成 第一节 概述 重点掌握： 第一节 概述 一、一些基本概念： 转录（transcription）： 反义链（antisense strand）： 二、RNA的结构和种类： 2. RNA分子的种类 三、RNA合成的特点： 模板识别阶段： 主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。 3) 转录的延伸： 是指RNA聚合酶离开启动子，沿DNA链移动并使新生RNA链不断伸长的过程。 五、RNA聚合酶： 1. 原核生物RNA聚合酶： β、 β’亚基：组成了聚合酶的催化中心。 只有带σ因子的全酶才能专一性地与DNA上的启动子结合，选择其中的一条链作为模板，合成均一的产物。 2. 真核生物RNA聚合酶： 真核生物三种ＲＮＡ聚合酶不仅分子巨大，而且比E.coli的RNA聚合酶要复杂得多，它们一般由8-14个亚基组成。 除了细胞核中的RNA聚合酶之外，真核生物线粒体和叶绿体中还存在不同的RNA聚合酶，但都不受α－鹅膏蕈碱所抑制。 第二节 原核生物的RNA生物合成 一、启动子的基本结构： 转录单元（transcription unit）： 转录起点： 1) －10区（Pribnow box）： TATAA －10区与－35区的功能： 3) －10区与－35区之间有一定的距离： 细菌启动子普遍具有以下4个基本特征： ※转录起点的碱基90%以上是嘌呤，通常是位于序列CAT中央A，但并非绝对。 ※ －35序列以－35为中心，由6bp组成共有序列TTGACA，每个碱基出现的概率是：T85T83G81A61C69A52 下降突变（down promoter mutations）： 上升突变通常增加与共有序列的相似性，或者使两个共有序列之间的距离接近17bp； E.coli rRNA的6个rrn操纵子启动子属于最强的原核基因启动子。这些具有高转录速度的强启动子序列除了和－35及－10共有序列（核心启动子元件，core promoter elements）比较一致外，位于－40至－60的富含A/T的序列必不可少，该序列叫上游元件（upstream element，UP element） 。 二、转录过程 1. 转录起始（注意转录复合物的变化）： 在起始阶段, 转录复合物形成后可进入两条不同反应途径： RNA聚合酶如何发现基因组中的启动子？ 第一个模型：随机扩散。RNA聚合酶全酶以随机扩散的方式运动，与非特异DNA迅速结合或解离，直到有机会遇到启动子并形成转录复合物。 第二个模型：直接交换序列。RNA聚合酶直接将所结合的序列与另一个序列迅速地、连续地进行交换，直到发现启动子并形成稳定的开放复合物，起始转录。直接交换序列，可以使RNA聚合酶沿着DNA有目标地运动，即从弱结合位点向强结合位点运动。 第三个模型：滑动。RNA聚合酶沿着DNA随机滑动，只有遇到启动子时才停止。 σ因子调节RNA聚合酶与DNA的结合 σ因子可以显著降低RNA聚合酶对非特异位点的结合能力。核心酶和非特异DNA可以形成稳定复合物，其离开DNA的半寿期为60min，而全酶－DNA复合物半寿期只有不到1sec。 σ亚基本身并无催化活性，其作用为识别DNA分子上的转录起始信号。 单一的核心酶负责合成转录产物，而σ因子负责位点的选择。E.coli细胞中存在多种σ因子，对应不同类型的启动子，以适应环境变化的需要。 σ因子的类型及其作用 2. 转录延伸： 3. 转录终止： 内在终止子由两个序列元件组成： 这些元件被转录形成RNA后才起转录终止作用： RNA产物中与内在终止子富含GC的反向重复序列对应的序列会形成一个茎环结构。 2. 茎环结构的3’端有一个连续U序列，与模板形成A:U碱基对。 依赖ρ因子的终止子： 具有转录终止作用的抗生素 利福霉素（rifampicin）：利福平是从链霉菌中提取的利福霉素的半合成衍生物，它在转录起始过程中抑制第一个磷酸二酯键的形成，对于RNA链的延伸无影响。其作用位点是RNA聚合酶的β亚基。 三、RNA的转录后加工 1.tRNA及rRNA分子由某些新生RNA链的裂解及化学修饰形成。 四、RNA合成的校正 在合成RNA链的过程中，RNA聚合酶还执行着两项校对（proofreading）功能： 第三节 真核生物RNA合成 （一）、RNA聚合酶II及其启动子： 通用转录因子（general transcription factor， GTF）：真核生物中有效并特异的起始转录所需要的几个起始因子。 3) RNA聚合酶II的最大亚基的C端，含有由若干个七肽－Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-重复顺序组成的C端结构域（CTD）。 2. 典型的RNA聚合酶I