蛋白质折叠问题简介.pdfVIP

7.88 堂笔记- 1 7.24/7.88J/5.48J 蛋白质折叠 学生复习： L 基酸的侧链和它们的pK值 L和D型 基酸的差异 肽键的平面性 程综述： 蛋白折叠的简介 本课程和你的角色 肽键和多肽链 纤维状蛋白和Pauling/Corey -螺旋 蛋白质折叠的简介 A. 蛋白质功能的多样性： 蛋白既是生命组成的基本构件，又是所有细胞的组成零件。它们实现了无数不同的功能， 使得细胞能够生长并繁殖。 酶–合成和降解 荷尔蒙 受体 膜蛋白 o 细胞外膜孔道蛋白 o 离子通道 o 转运蛋白 o 光合成 o ATP/能量再生 o 光受体 复制酶和聚合酶 球形蛋白–微管蛋白，鞭毛蛋白 纤维状蛋白– 胶原蛋白，角蛋白 发动机蛋白–驱动蛋白，肌浆球蛋白 B. 氨基酸序列决定了蛋白的性质： 二战以前，人们普遍认为蛋白质的性质是由它们的组成决定的。然而，随着Frederick Sanger(1949-1951)提出的沿着多肽链顺序分析 基酸方法的发展，以及其后胰岛素序 列的完全确定，事实已经变得很清楚，蛋白质的性质取决于其 基酸的序列。 典型的蛋白质： 20种不同的 基酸的线性聚合体，没有分支； 一个物种所有的分子都有严格的特异的 基酸序列，没有改变。 考：为什么氨基酸序列没有分支？下周一进行讨论： 通过结构研究，我们了解了 基酸序列；通过对 基酸序列组合的研究，我们找到了问 题的关键点。 然而，去折叠的蛋白几乎没有任何特性！ Scrambled Eggs: Jell-O: 蛋白的性质反映了侧链的线性序列和决定其空间的因素之间的相 作用。 C. 在高度协同的三维结构中，功能依赖于序列 序列和结构之间的关系是现代生物学和本课程中最基本的问题。 D. 生命有机体中有多少种蛋白？ 完整基因组测序的进展使得我们可以相对精确地估计有机体使用的蛋白种类： 原核生物：1,600 – 5,000 真核生物：10,000 – 50,000 E. 生物学上多肽链长度的分布 图1.0: 蛋白长度(氨基酸) 上面的数据显示了不同的物种中多肽链长度的分布： 8个微生物基因组中，平均长度大约是340个残基 大多数是190个残基 真核生物较长，因此酵母的平均长度是470个残基 5500个结构(10,800个结构域) 154个免疫球蛋白结构域 222个T4溶菌酶的结构 Gerstein ：估计有1135个代表性的结构域，无重复结构 所以看来达到了1200个独一无二的结构域 蛋白数据库中，平均长度是170个残基，结构致密的更短，为120个 短的蛋白是什么样呢？它们的序列已经确定，很显然，非常短的序列极少是由基因编码 的。但在动物中，通常是由长链的水解产生的…… F. 可能的氨基酸序列是一个天文数字： 假定使用20种 基酸，多肽链长度一定，从理论上可以推测， 基酸序列不同的组合数 将是一个天文数字。 假设在多肽链的每一个位置可以使用20种 基酸中的任何一个，那么即便是一个200个 基酸残基组成的小蛋白，其可能的序列组合(20200)就已经远远超过了宇宙中的所有原 子数目之和。 正是由于序列的复杂性才导致了生命有机体的复杂性。 这赋予了蛋白识 、选择和催化的特异性权力，正如形成基本成分的结构一样。