狸猫α-干扰素全基因的克隆及生物信息学分析.PDF

安徽农业大学学报, 2012, 39(1): 55-60 Journal of Anhui Agricultural University [DOI]CNKI：34-1162/S1031.032 网络出版时间：2011-10-25 10:31:41 [URL]/kcms/detail/34.1162.S1031.032.html 狸猫 α-干扰素全基因的克隆及生物信息学分析 1 1 1 1* 1 1 2 朱前磊 ，王亚丹 ，崔保安 ，陈红英 ，魏战勇 ，王子馨 ，段廷云 (1. 河南农业大学牧医工程学院，郑州 450002 ；2. 漯河出入境检验检疫局，漯河 462000) 摘 要：根据猫α－干扰素基因核苷酸序列，设计并合成了1 对引物，PCR 扩增狸猫α－干扰素全基因，并克 隆、测序。用DNAStar 软件及在线分析方法对克隆的IFN-α基因核苷酸及其推导氨基酸序列进行分析，并与人和 其他种动物的IFN-α基因进行同源性和进化分析。结果表明，获得了狸猫α－干扰素全基因序列，其大小为631 bp ， 编码194 个氨基酸的多肽，推导氨基酸序列有1 个潜在的N-糖基化位点和7 个潜在的O-糖基化位点。IFN-α基因 存在种属的差异性，亲缘关系越近，同源性越高。狸猫IFN-α基因的成功克隆为进一步研究猫IFN-α基因表达、生 物学活性和应用奠定基础。 关键词：狸猫；α－干扰素基因；基因克隆；生物信息学 中图分类号：Q959.838 文献标识码：A 文章编号：1672−352X (2012)01−0055−06 Cloning and bioinformatics analysis of IFN- αgene of wild cat 1 1 1 1 ZHU Qian-lei , WANG Ya-dan , CUI Bao-an , CHEN Hong-ying , 1 1 2 WEI Zhan-yong , WANG Zi-xin , DUAN Ting-yun (1. College of Animal Husbandry and Veterinary, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002; 2. Luohe Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Luohe 462000) Abstract: One pair of primer was designed and synthesized according to the feline interferon alpha gene (IFN-α) nucleic acid sequence. Wild cat IFN-α was amplified by PCR, then cloned and sequenced. The nucleotide sequence of the amplified IFN-α gene and the amino acid sequence deduced from the gene were then analyzed by the DNAstar software and on-line tools, and the similarity and evolution of IFN-α gene were analyzed among wild cat, human and other