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- 2017-06-07 发布于湖北
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·266 · 医学研究生学报 2017年3月 第30卷 第3期 J Med Postgra,Vol.30,No.3,March,2017
论 著
(临床研究)
激素敏感型及依赖型肾病综合征患儿基因甲基化研究
及其生物信息学分析
张佳仪,芮淑敏,高春林,夏正坤
[摘要] 目的 目前关于激素敏感型肾病综合征(SSNS)及激素依赖型肾病综合征(SDNS)患儿的基因甲基化研究较少,
文中旨在筛选SSNS和SDNS 甲基化差异表达的基因,并进行生物信息学分析,探讨可能的发病机制及寻找潜在的治疗靶标。
=
方法 选择2015年1月至12月在南京军区南京总医院儿科住院患者7例,SSNS者(n 3):泼尼松足量[2mg/ (kg ·d)或60
2
=
mg/ (m ·d)]治疗,4周内尿蛋白转阴者;SDNS者(n 4):对激素治疗敏感,但是连续2次减药或停药2周内复发者。 分别提
取2组患儿的外周血DNA,利用基因甲基化芯片技术筛选差异表达的甲基化基因,并对其进行生物信息学对检测结果进行分
析。 结果 甲基化芯片结果发现,与SSNS组比较,SDNS组存在318个差异甲基化基因,其中有 193个基因表达为高甲基
化,125个为低甲基化;这些异常基因主要位于DNA 的开放阅读框和CpG岛区域。 甲基化差异基因主要涉及Rho鸟嘌呤核苷
酸交换因子活性、核苷三磷酸酶调节活性、GTP 酶调节活性等分子功能。 生物学过程方面主要涉及调节前体代谢产物和能
量、抗原加工提呈、Rho及Ras蛋白信号传导通路、伪足集合、再生等生物过程。 在细胞组成方面,主要涉及MHC蛋白复合物、
染色质周纤维及MHC 1类分子的蛋白复合物。 通过KEGG信号通路分析发现,差异基因主要参与9个信号通路,其中主要涉
及I型糖尿病、淀粉与蔗糖的代谢、同种异体移植物的排斥和自身免疫性甲状腺病等信号通路。 结论 广泛存在的SDNS
患儿基因异常甲基化现象,为激素依赖的原因之一,这为寻找潜在的治疗靶标提供了依据。
[关键词] 原发性肾病综合征;甲基化芯片;激素依赖
[中图分类号] R692 [文献标志码] A [文章编号] 1008⁃8199(2017)03⁃0266⁃05
[DOI] 10.16571/ j.cnki.1008⁃8199.2017.03.009
Differentially methylated genes in children with steroid⁃dependent or steroid⁃sensitive nephrotic syndrome:
A bioinformatic analysis
ZHANGJia⁃yi,RUI Shu⁃min,GAO Chun⁃lin,XIA Zheng⁃kun
(Department of Pediatry,School of Medicine,Southern Medical University / Nanjing General Hospital of Nanjing
Military Region,PLA,Nanjing 210002,Jiangsu,China)
[Abstract ] Objective Few researcheshavebeenreportedonthegenemethylationinchildrenwith steroid⁃sensitivenephrot⁃
ic syndrome (SSNS) or steroid⁃dependent nephrotic syndrome (SDNS). This study aimed to investigate the possible pathogenesis and
therapeutic targetof SSNSandSDNSby screeningdifferentiallymethylatedgenes (DMGs)andbioinformaticanalysisusingDNAmeth⁃
ylation microarray. Methods This study included 3
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