e基因家族的全长cDNA克隆及表达分析.PDFVIP

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  • 2017-06-10 发布于湖北
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江苏农业科学 2016年第44卷第4期 — 41— 翟立红,周兰庭,韩 鹏,等.玉米Argoanute基因家族的全长cDNA克隆与表达分析[J].江苏农业科学,2016,44(4):41-45. doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2016.04.011 玉米Argoanute基因家族的全长cDNA克隆与表达分析 1 1 1 1,2 翟立红 ,周兰庭 ,韩 鹏 ,腾 峰 (1.湖北文理学院生物化学与分子生物学系,湖北襄阳441053;2.湖北腾龙种业有限公司,湖北利川445400)   摘要:Argonaute(AGO)蛋白是小RNA分子诱导的沉默复合体(RISC)的核心因子,以玉米自交系B73为材料,利 用RLM-RACE技术,克隆得到玉米17个AGO基因的全长cDNA序列,发现6个成员具有5′非翻译外显子,可能其表 达受此机制调控。同时,利用半定量 RT-PCR对其在玉米幼苗不同根系组织(包括初生胚根、冠根、次生胚根和侧 根)进行表达分析,结果表明:未检测到ZmAGO5b、ZmAGO18b表达,ZmAGO1a/b、ZmAGO2a、ZmAGO10在各类根系中高 水平表达,其他11个ZmAGOs表达水平较低,因此揭示选择性表达不同的ZmAGOs可能是不同类型的根系分化及其 功能的精细调控所必需的。   关键词:Argonaute基因;克隆;5′非翻译外显子;表达   中图分类号:S513.01;Q785  文献标志码:A  文章编号:1002-1302(2016)04-0041-04   在真核生物中,小 RNA(smallRNA:sRNA)介导转录水 水稻和拟南芥AGO蛋白划分为四大类,分别为AGO1、MEL1/ [15] 平、转录后水平以及染色质水平的基因沉默。植物内源 AGO5、ZIPPY/AGO7和 AGO4 。Zhai等将玉米中的AGO sRNA包括 microRNA(miRNA)和各类小干扰 RNA(short 蛋白划分为五大类,将与OsAGO18同源性较高的2个蛋白单 [1] [16] interferingRNA,siRNA) 。在已知的由sRNA介导的基因表 独划为一类 。目前证实,植物中的AGO1主要参与miRNA 达调控途径中,sRNA必须与Argonaute(AGO)蛋白形成沉默 通路,在植物的各个生长发育阶段均起着重要的调控作 [9,17] 复合体(RNA-inducedsilencingcomplex:RISC)引导sRNA通 用 。在拟南芥中,与AtAGO1亲缘关系最近的AtAGO10 过序列互补与靶标(RNA或DNA)结合,进而降解 mRNA、抑 突变后表现为茎尖分生组织发育异常,AtAGO1和AtAGO10 [1] 制翻译或修饰染色质 。由此可见,AGO蛋白是 sRNA行使 竞争结合miR165/miR166,调节HD-ZIP 的表达,进而调 Ⅲ [18] 其功能的重要因子。Argonaute蛋白最初是在植

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