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- 2017-06-10 发布于湖北
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真核生物的胞嘧啶甲基化
课程:生命科学导论(H)
姓名学号:范嘉祺 3110102659
学院:竺可桢学院
专业班级:巴德年1102班
指导教师:吴敏 唐建军
上课时间:周二3、4节 周五1、2节
真核生物的胞嘧啶甲基化
Eukaryotic cytosine methylation
摘要:其实人类基因与简单生物相比并未多多少。因此,高等生物的复杂性不在于有更多的结构蛋白编码基因,而在于复杂的基因调控机制,而真核生物的胞嘧啶甲基化为协助沉默提供了一种可遗传的精确调控方式。
关键词:真核生物、胞嘧啶甲基化、遗传调控
1.胞嘧啶甲基化
众所周知的是,细胞中的碱基有四种类型:A、G、C、T而C就是胞嘧啶。在真核生物中,甲基化只发生在胞嘧啶第五位碳原子上,它是由DNA甲基转移酶所催化,以S-腺苷-L甲硫氨酸(SAM)作为甲基供体,将甲基转移到胞嘧啶上,生成5甲基胞嘧啶的一种反应。其过程具体包括:
1.识别目标胞嘧啶,并将其移入催化袋内;
2.酶的催化结构域中的半胱氨酸残基与胞嘧啶环上的第六位碳原子形成共价中间体,破坏整个碱基的芳香环构型,从而使第五位上的碳原子活化;
3.在酶的催化下,把SAM的甲基转移到胞嘧啶的第五位碳原子上,随后,第五位碳原子的质子被释放,第六位碳原子的共价键断裂,SAM转化为S-腺苷高半胱氨酸(SAH)
2.CpG二核苷酸
2.1.CpG①二核苷酸与甲基化
CpG二核苷酸是真核生物中绝大多数甲基化发生的位点,两条链中相对两个CpG中的5甲基胞嘧啶在DNA双链大沟中呈特定的三维结构。
2.2CpG在DNA中比例(CG抑制现象)
首先,我们计算一下CpG在DNA中的理论值是多少。DNA是由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)四种碱基组成,对于双核甘酸,每核出现碱基的情况共有4种,所以根据乘法计数原理,共有4*4=16种二核苷酸组合形式。理论上,对于每种组合,出现的情况是等概率的,所以,DNA中应该有1/16(约6%)为CpG,但事实上,CpG在人类基因组中的含量极低(小于1%)。这种现象称为CG抑制现象。
2.3CG抑制现象的原因
CG抑制现象的原因与5甲基胞嘧啶的高突变率有关。事实上,人体内存在两个过程,5甲基胞嘧啶的转变,以及人体对这一转变造成损伤的修复。
2.3.1 5甲基胞嘧啶的转变
事实上,5甲基胞嘧啶无论是在体外还是在体内,不需要酶促,就能很容易地自发脱氨基转变为胸腺嘧啶(T),从而导致了部分CG变成TG。5甲基胞嘧啶的这种自发脱氨基反应的速度是有酶介导的非甲基化胞嘧啶脱氨基生成尿嘧啶(U)的两倍以上。
2.3.2人体的修复
体内对5甲基胞嘧啶与非甲基化胞嘧啶各自的反应所造成的损伤的修复速度相差很大。由于在DNA中,尿嘧啶(U)属于非正常碱基,因此容易被人体的DNA修复系统②所识别并有效地修复。而5甲基胞嘧啶脱氨基转化为胸腺嘧啶(T)则不易被识别与修复。
综合以上两种现象,5甲基胞嘧啶脱氨基速度快,但是修复地慢,造成的结果是人体内TG的积累以及CG的减少。所以,CG在人体的含量比较低。
3.CpG岛
正如之前所说的,人体中约70%~80%的CpG二核苷酸的胞嘧啶是呈甲基化状态的,成为甲基化的CpG位点,大部分分散于重复序列中。
但是,还是存在为甲基化的CpG位点的,它们成簇排列构成CpG岛。
3.1CpG岛的标准定义:基因组中长度为300~3000 bp的富含CpG二核苷酸的一些区域,主要存在于基因的5′区域。’端,尤其是在启动子和第一外显子,不过,在3’端也是存在的。数据表明,超过60%的人类基因启动子含有CpG岛,这说明,CpG可能在基因的表达调控中发挥重要的作用。
事实上,CpG岛通常是强启动子,常作为复制起始点。启动子区中CpG岛的未甲基化状态是基因转录所必需的,而CpG的甲基化可导致基因转录被抑制。核酸的书写规则规定在各碱基之间需要加一个小写的p作为相邻两个核苷酸靠磷酸二酯键相连接的标志珝琲
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