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FXR1P与Btf相互作用的鉴定-论文.doc
FXR1P与Btf相互作用的鉴定*论文
.freelids from the blue clones,ed cDNA library in yeast t. And transform them into E.coli Top10 and select transformants p+ plates. Then culture the transformants and extract the AD/library plasmids,ed into Y187 for ninimating ed ay be the gene Btf. Conclusion There exists the interaction betental retardation 1,FMR1),其编码蛋白FMRP的缺失或低表达导致疾病的发生。1995年Zhang Y 等[2]克隆出两个定位于常染色体(3q28和17p13.1)、与FMR1基因非常相似的基因,命名为脆性X相关基因1(FXR-1)和脆性X相关基因2(FXR-2),分别编码FXR1P和FXR2P,它们和FMRP有较高的同源性。有学者运用酵母双杂交体系、免疫亲和层析以及基质辅助的激光解吸电离质谱方法,相继发现了一些FMRP相互作用蛋白,包括脆性X相关蛋白FXR1P和FXR2P、核仁素、核FMRP相互作用蛋白(nuclear FMRP interacting protein,NUFIP)、核糖体蛋白、泛素结合酶9(ubiquitin-conjugating enzyme 9,UBC9)、胞浆FMRP相互作用蛋白(cytoplasmic FMRP interacting proteins,CYFIP)、核苷酸二磷酸激酶亚基B、T/G错配糖苷酶(T/G mismatch-spicific DNA thymine glycosylase,TDG)、82-FIP(82-kD FMRP interaction protein)[3~5]。FXR1P是否也与这些蛋白发生相互作用?还与其他哪些蛋白发生相互作用呢?故筛选并研究FXR1P的相互作用蛋白,不但可以初步了解其功能,还可以为脆性X综合征的发病机制提供新的依据。本文通过进一步验证酵母双杂交文库筛选过程中得到蓝色克隆,确认FXR1P和Btf的相互作用,为FXR1P下一步的功能研究奠定基础,为脆性X综合征发病机制的研究提供新的依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株和质粒 大肠杆菌Top10实验室保存,酵母菌株Y187和AH109购自Clontech公司;质粒pGBKT7和pGADT7购自Clontech公司。
1.1.2 主要试剂 酵母SD培养基,SD/-His/-Leu/-Trp,SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp培养基,X-β-半乳糖苷(X-gal)等购自Clontech公司;醋酸锂购自Sigma公司;其他试剂均国内购买。
1.2 方法
1.2.1 蓝色克隆文库质粒的分离 通过文库筛选我们已经得到了一些蓝色克隆,利用Lyticase酶裂解法提取蓝色克隆的酵母质粒,CaCl2法转化感受态Top10,铺在LB/Amp板上,以阳性菌落提取提取质粒。
1.2.2 酵母感受态的制备 挑Y187单克隆至1ml YPDA液体培养基中,高速振动打散细胞,并将此含有酵母单克隆的YPDA液体培养基转入50ml YPDA 液体培养基中,30℃,230rpm,孵育18~24h,至OD600≥1.5;再将此培养基倒入400ml YPDA 液体培养基中使OD600=0.2-0.3,30℃ 230rpm,振摇至OD600=0.5±0.1;转移此菌液至50ml离心管中,于室温1000×g转速下离心5min,弃上清,无菌TE重悬细菌沉淀;再次离心弃上清后,用新鲜制备的无菌的1×TE/1×LiAc重悬细菌沉淀,准备做转化。
1.2.3 感受态酵母细胞的转化 在每支1.5ml EP 管中加入0.1μg AD/Library 质粒和0.1mg鲑精DNA,混匀;加入0.1ml酵母感受态细胞,振荡充分混匀;加入0.6ml 无菌PEG/LiAc 溶液,高速震荡10s;30℃ 200rpm振摇30min;加70μl DMSO,颠倒混匀;42℃热休克15min,立即置冰浴1~2min;室温14000rpm离心5s,弃上清,0.5ml无菌1×TE缓冲液重悬细菌沉淀;取0.1ml铺亮氨酸缺陷培养基(SD/-Leu)平板上,筛选所需的AD/Library/Y187。
1.2.4 一对一酵母配合 挑取AD/Library/Y187和pGBKT7/FXR1/AH109单克隆同时置于装有0.5mlYPDA培养基的EP管里,震荡充分重
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