【2017年整理】深度与测序技术简介.pptVIP

Sample fragmentation Library preparation Sequencing reaction Data analysis; ;;; ;;;;1;Solexa 测序 Workflow; ;文库制备：微珠单分子克隆;1024种8碱基探针 4色荧光，4种双核苷酸，每色荧光有256个探针(4^6);;连接法测序（二）;连接法测序（三）;454 sequencing 读取长度大，400bp 可以对未知基因组进行从头测序de novo sequencing 当遇到polymer时，如AAAAAA等，荧光强度和碱基个数不成线性关系，判定重复碱基个数有困难 Solexa sequencing 高度自动化的系统 读取片段多，适合进行大量小片段的测序，如microRNA profiling 基于可逆反应，随反应轮数增加，效率降低，信号衰减，读取序列较短，给de novo sequencing 拼接带来困难 SOLiD sequencing 每个碱基读取两次非常高的准确性，特别是对于SNP的检测 灵活的系统，完善的磁珠编码系统，可以进行样品的pooling，分割测序区域 读取长度受连接反应的轮数限制，给de novo sequencing 拼接带来困难 ;De novo 测序 基因深度测序（genome re-sequencing） 转录组深度测序（transcripto