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园 艺 学 报 2013 ,40 (2 ):333 –340 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
基于 SSR 标记的四川野生中国樱桃遗传多样性
和居群遗传结构分析
1,2 1,2,* 1,2 1,2 1,2 1,2
陈 娇 ,王小蓉 ,汤浩茹 ,陈 涛 ,黄晓姣 ,梁勤彪
1 2
(四川农业大学园艺学院,四川雅安 625014 ; 四川农业大学果蔬研究所,成都 611130 )
摘 要:采用 SSR 分子标记技术对四川野生中国樱桃 5 个居群共 133 株的遗传多样性水平及居群的
遗传结构进行了研究。结果显示:10 对 SSR 引物共检测到 78 个等位基因,平均每位点等位基因 7.8 个。
Nei’s 基因多样性指数(H )为0.6112 ~ 0.6689,Shannon’s 信息指数(I )为 1.1984 ~ 1.3786。基于分子方
差分析(AMOVA ),92.53% 的变异来自居群内,7.47% 的遗传变异来自于居群间。居群间遗传距离(GD
0.2416 )、遗传一致度(GI 0.7854 )、遗传分化指数(Fst = 0.0844 )以及较强的基因流(Nm = 2.7125 )均
表明居群间的遗传分化水平较低,居群内存在显著近交现象(Fis = 0.3986 ),且居群在大多数位点上偏离
Hardy-Weinberg 平衡。基于上述结果,分析讨论了居群较高遗传多样性和居群间较低遗传分化形成的可能
原因,并提出野生中国樱桃的保护利用策略。
关键词:野生中国樱桃;SSR;遗传多样性;遗传结构
中图分类号:S 662.5 文献标志码:A 文章编号:0513-353X (2013 )02-0333-08
Assessment of Genetic Diversity and Populations Genetic Structure in Wild
Chinese Cherry from Sichuan Province Using SSR Markers
CHEN Jiao1,2 ,WANG Xiao-rong 1,2,* ,TANG Hao-ru1,2 ,CHEN Tao1,2 ,HUANG Xiao-jiao 1,2 ,and
LIANG Qin-biao1,2
1 2
(College of Horticulture,Sichuan Agricultural University ,Ya’an,Sichuan 625014 ,China;Institute of Pomology and
Olericulture,Sichuan Agricultural University ,Chengdu 611130 ,China )
Abstract :Genetic diversity and genetic structure of five wild Chinese cherry (Prunus pseudocerasus
Lindl. )populations from Sichuan were investigated using ten SSR markers selected from 31 markers. A
total of 78 alleles were successfully amplified ,and the number of alleles per locus ranged from 5 to 10,
with an average of 7.8. The rela
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