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12-结构生物学导论-5资料
电子密度图的解释 和结构修正 电子密度函数 ? ? (xyz) =（1/v）∑∑∑ Fhkl exp[-2?i (hx+ky+lz)] h k l Fhkl = | Fhkl | exp (i? hkl ) Fourier 加和,采用用快速Fourier变换技术 通常在三维晶胞中按 dmin/3 的格点进行计算 分析电子密度图 → 二级、三级、四级结构 结构模型，原子坐标(不包括H原子) 晶体结构的分辨率 2dmin Sin ?max = ? dmin = ?/2 理论极限 ? 衍射分辨率 分辨率描述结构的精细程度 分辨率和hkl指数大小相关 ?-螺旋 6 ? 5? 4? 3 ? 2 ? ?-折叠片 6 ? 5? 4? 3 ? 2 ? 3 ? 1.6 ? 不同分辨率电子密度图 提供的结构信息 低分辨率 5 ~ 6 ? 分子形状、大小、非晶体学对称性 中分辨率 2.5 ~ 3.5 ? 跟踪肽链、二级结构、侧链取向 高分辨率 1.5 ~ 2.0? 侧链的精细结构、活性中心精细结构、辅基、 有序溶剂分子、其他小分子和离子 结构修正 晶体结构修正的目的和任务 结构可靠性的判据 修正方法 结构模型误差的来源 生物大分子结晶不完善，导致： 衍射强度低，误差大 衍射数据分辨率有限 相角推算过程引入的误差 电子密度的解释和模型构建过程引入的人为的误差 晶体学修正的目的 调整结构参数?改进结构模型与衍射数据之间的吻合程度 同时保持结构模型的立体化学合理性 F(hkl)=K ∑ qj fj exp[2 ? i (hxj+kyj+lzj) - B j (Sin ? / ? )2] j F(hkl)= |F(hkl)| exp [i ?(hkl)] 结构参数 (H除外) ：坐标 xj
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