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园 艺 学 报 2011 ,38 (9 ):1667 –1674 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
香蕉根系均一化全长 cDNA 文库的构建和鉴定
1,4 1 3 2 1,2,*
王 卓 ,殷晓敏 ,王家保 ,徐碧玉 ,金志强
1 2
(中国热带农业科学院海口实验站,海口 570102 ; 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带生物技
3 4
术重点开放实验室,海口 571101 ; 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海南儋州 571737 ; 海南大学,海
口570228 )
摘 要:以香蕉幼苗根系为材料,利用 DSN (duplex-specific nuclease )均一化技术与 SMART(switching
mechanismat 5′end of RNA transcript )技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA 文库。经检测,初级
6 -1 6
文库滴度 1.1 × 10 cfu · mL ,库容 5 × 10 个独立克隆,重组率大于 95%,插入片段平均长度大于 1 kb,
表明文库质量较好。随机挑取 192 个克隆进行 EST (expressed sequence tags )测序,成功获得 179 个高质
量 EST ,含 5 个 conting 和 174 个 singlet,冗余度仅为 2.35% 。小规模测序拼接后获得 145 个 unigenes ,
对 unigenes 分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选 3 个与其它植物同源的抗逆基因,利
用 RT-PCR 方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这 3 个基因在不同的逆境下差
异表达。
关键词:香蕉;根系;均一化;cDNA 文库;基因;表达
中图分类号:S 668.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X (2011 )09-1667-08
Construction and Characterization of Normalized Full-length cDNA
Library of Banana Roots
1,4 1 3 2 1,2,*
WANG Zhuo ,YIN Xiao-min ,WANG Jia-bao ,XU Bi-yu ,and JIN Zhi-qiang
1 2
(Haikou Experimental Station ,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Haikou 570102,China;Institute of
Tropical Bioscience and Biotechnology,Chinese Academy
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