果实软化相关PG基因的进化分析和基因组定位.pdfVIP

园 艺 学 报 2011 ，38 （9 ）：1791 –1799 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 果实软化相关PG 基因的进化分析和基因组定位 * 魏 潇，刘威生 ，刘 宁，章秋平，张玉萍，刘 硕，刘有春 （辽宁省果树科学研究所，国家果树种质熊岳李杏圃，辽宁熊岳 115009 ） 摘 要：利用 NCBI 数据库和蔷薇科基因组数据库中的数据对 48 个果实 PG 基因进行系统进化分析， 结果表明 3 个进化支中都包含与果实软化相关的 PG 基因，属于 A 支和属于 B 支的 PG 基因有明显的功能 差异。氨基酸序列分析显示，3 个进化支中的 PG 基因存在多个差异位点，A 支和 C 支 PG 基因的 N 端比 B 支短 60 ~ 70 个氨基酸。PG 基因结构（包括启动子、内含子和编码区）的变异对其功能差异有重要影 响。对苹果和桃的 PG 基因进行了基因组精确定位，其附近存在果实软化相关性状标记。 关键词：多聚半乳糖醛酸酶基因；果实软化；系统进化分析；基因组定位 中图分类号：S 66 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2011 ）09-1791-09 Phylogenetic Analysis and Genomic Localization of Polygalacturonase Genes Related to Fruit Softening * WEI Xiao ，LIU Wei-sheng ，LIU Ning ，ZHANG Qiu-ping ，ZHANG Yu-ping ，LIU Shuo ，and LIU You-chun （Liaoning Institute of Pomology ，National Germplasm Repository for Plums and Apricots ，Xiongyue ，Liaoning 115009， China） Abstract ：Forty-eight PG genes were classified into three major clades by phylogenetic analysis and each clade contained PG genes that involved in fruit softening. PG genes belonged to clade A and clade B had functional divergence obviously. There were some different amino acid sites in amino acid sequence of PG genes from different clades. PG genes in clade A and clade C had a deletion of 60 –70 amino acids in N terminal end compared with PG genes in clade B. Variation in the structure of PG genes （mainly including promoter regions，introns and encoding regions ）had a significant impact on their functions. PG genes in apple and peach were accurately localized in genome respectively and around the genes there were some fruit softening markers. Key words ：polygala