高通量技术在肠道微生物.pptxVIP

高通量技术在肠道微生物 宏基因组学研究中的应用; 诺贝尔奖获得者Joshua Lederberg认为，人是一种由自身细胞和肠道菌群组成的超级生物体。人体肠道菌群编码的基因组可被视为“人的第2基因组”，它们参与人体的营养、代谢和免疫过程，是影响人体健康最重要的因素之一。 由此对肠道微生物宏基因组学的研究成为当今的热点。高通量测序技术具有诸多优越性，使研究者不仅能够深入分析肠道菌群结构和多样性，还能结合其它“组学”技术进一步了解肠道微生物的基因功能和代谢途径。 ; 人体肠道为微生物提供了良好的栖息环境，共生微生物多达1000 多种，成人肠道内微生物的数量大约是1012~1014 个， 不仅远远大于体表其它微生物的数量，而且是人体自身细胞数的10 倍。从基因层面上看， 人体自身的基因组大约携带了2.5 万个基因，而人体???道微生物编码的基因总数约是人自身基因总数的150 倍,人的基因组与人体肠道微生物宏基因组相互协调，和谐一致，共同作用于人体的免疫、营养和代谢过程.;; 1987 年，以双脱氧核苷酸末端终止法（Sanger法）为代表的第1 代测序技术诞生[13]，Sanger 法以 其高准确度（99.999%）以及较长的读长（1 000 bp） 在人类基因组计划（Human genome program， HGP）中发挥了巨大作用。然而制约于成本高，通 量低以及测序速度慢的缺点Sanger 法已不能满足于宏基因组测序分析。 随后，高通量测序技术登上基因组学研究的舞台。; 高通量测序技术是目前基因组学研究中应用最广泛的测序技术， 它有效避免了Sanger 法繁琐的克隆过程，具有通量高，速度快，成本低等优点。 目前， 主流的高通量测序技术主要包括454 公司 的GSFLX 测序平台、Illumina 公司的Hiseq 和 Miseq 测序平台以及Life Technologies 公司的Ion torrent PGM 和Ion proton 测序平台，3 大公司测序平台的比较结果如表1 所示。;;;;;;;