对水稻第4 号染色体长臂近端粒区一个过氧化物酶基因簇的结构分析.pdfVIP

生 物 化 学 与 生 物 物 理 学 报 ISSN ACTA BIOCHIMICA et BIOPHYSICA SINICA 2001 , 33 (2) : 163 - 172 CN 311300/ Q 对水稻第 4 号染色体长臂近端粒区一个 过氧化物酶基因簇的结构分析 陈泽华 　周 　波 　韩 　斌 　钱跃民 　洪国藩 ( 中国科学院国家基因研究中心, 上海 200233 ) 摘要 　　通过对定位BAC 克隆 q3037 ( H0207F01) 的序列测定和分析 , 在其中一个 22. 5 kb 的区域发现一个由5 个 ( ) 第三类过氧化物酶基因 依次命名为 osp 1 、osp 2 、osp 3 、osp 4 、osp 5 组成的基因簇。分析表明 , osp 1 、osp 2 和 osp 3 分别含 1 个内含子 , osp 4 和 osp 5 分别含 2 个内含子 。该5 个基因分别编码 338 、335 、336 、343 和 346 个氨基酸残基 的蛋白质 , 而且都具有 N 端信号肽序列 , 其中 OSP1 、OSP4 、OSP5 为阴离子过氧化物酶 , OSP2 、OSP3 为阳离子 过氧化物酶。对 5 个基因间的两两比较分析和进化分析结果表明 : 该基因簇是通过一系列的串联基因复制事件而 ( ) 形成 ; osp 5 与来自玉米的 ap 1 和来自大麦 Hordeum vulgare 的 prx 7 为潜在的直向同源基因 , 而且 , osp 15 与 ap 1 、prx 7 构成了分泌性植物过氧化物酶基因家族中一个新的分枝。 关键词 　　过氧化物酶 ; 基因簇 ; 串联基因复制; 直向同源基因 ( ) 　　含血红素的过氧化物酶 EC1. 11. 1. 7 广泛分 之。家族基因的成簇分布现象在很多基因组中都被 α 布于动、植物和细菌、真菌中 , 它能氧化一系列的有 观察到过 , 并被广泛研究。例如 , 3 个水稻的 淀 机和无机物 , 同时消耗 H O [1 ] 。根据序列相似性 , 粉酶基因被发现成簇分布于一个 28 kb 的区域[4 ] ; 2 2 来源于细菌、真菌和植物的过氧化物酶可归为同一 对光敏感的、编码二磷酸核酮糖羧化酶小亚基的基 个超家族 , 与动物的过氧化物酶家族起源不同 ,差 因家族在单子叶、双子叶植物中都存在成簇分布现 异显著。来源于细菌、真菌和植物的过氧化物酶基 象[5 ] ; 在拟南芥菜基因组中 , 3 个腈水解酶基因 ( ) ( nit 2/ nit 1/ nit 3) 成簇分布于 13. 8 kb 的区域[6 ] ,5 因家族又可分为三类: 胞内过氧化物酶 I 类 、分泌 ( ) ( ) 性真菌过氧化物酶 II 类 和分泌性植物过氧化物酶 个细胞壁偶联的受体激酶基因 w ak 1～5 集中分布 ( III 类) [2 ] 。植物过氧化物酶被认为与植物的生长、 在一个 30 kb 的区域[7 ] 。 发育、逆境耐受、防御反应