蛋白质组学在非生物胁迫中的研究进展.ppt

蛋白质组学是继基因组研究之后的又一核心和具有广泛应用价值的学科。蛋白质组学就是对一个基因、一种生物、一种细胞或组织所表达的全部蛋白质的研究。蛋白质组学可以系统地确定细胞或组织内的每一个蛋白质的表达、蛋白质复合体的组成、蛋白质的互作关系和每一个蛋白质的丰度与被修饰的状态等。 利用蛋白质组学的方法研究植物对这些胁迫的响应,为进一步揭示植物响应胁迫机理提供了新的途径,植物蛋白质组学研究已在许多物种中开展。 对植物发育的不同阶段、不同组织及器官、不同的细胞器以及膜的蛋白质组进行了较为系统的研究。 对胁迫条件下蛋白质组的变化也有较多的研究,对抗逆应答蛋白的鉴定、解析植物抗逆机制具有十分重要的意义。 一、非生物胁迫下蛋白质组学研究 一、非生物胁迫下蛋白质组学研究 砷是一种无机有毒物质,在对砷胁迫水稻根系蛋白质组学研究中发现有23个砷调节蛋白,其中S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)、GSTs、半胱氨酸合成酶(CS)、GST-tau和酪氨酸特异性蛋白磷酸酶蛋白(TSPP)为砷胁迫上调蛋白。 CS还受H2O2的调节,说明CS的表达被砷或砷诱导的氧化胁迫调节。因GST-omega仅被砷诱导而不被亚硝酸盐、铜或铝诱导,推测它在砷胁迫中起特殊作用。 研究大豆镉胁迫的应答蛋白，Sobkowiak等将悬浮培养的大豆细胞置于不同浓度的镉和35S-标记的蛋氨酸中，并设置三个不同的时间段，然后从细胞中提取蛋白进行SDS,CBB染色，新合成的35S-标记的蛋白通过自显影检测分析。挑取蛋白条带进行LC ESI-Q-TOF MS分析后，共鉴定出12个蛋白，其中，8个与抗氧化防御机制有关，一个被鉴定为过氧化物歧化酶[Cu-Zn],另外 7个被鉴定为谷胱甘肽-S-转移酶。 过氧化物歧化酶[Cu-Zn]表达量的提高，表明镉胁迫导致了细胞活性氧的产生。 为研究 Al-耐受植物的防御机制，Zhen等采用经典的 2-DE 以及 MALDI-TOF MS 技术，共鉴定出30个 Al-耐受相关蛋白。 其中，HSPs家族蛋白是在Al 胁迫下新诱导出来的，这表明热激蛋白可能起保护大豆根细胞，防止其降解和变性的作用； 半胱氨酸合成酶也暂时增加，表明其在适应 Al胁迫中也起到了关键的作用。 Lin等研究了高温对水稻颖果发育的影响，在70个差异表达的蛋白中54个用质谱的方法得到鉴定。21个蛋白参与碳水化合物的代谢,14个参与蛋白质的合成与分拣,9个是胁迫响应基因。小分子热激蛋白、3 -磷酸甘油醛脱氢酶及醇溶蛋白被上调,而腊质蛋白、过敏原类蛋白和蛋白延伸因子1β被下调。 Lee等分析了经42℃处理12 h和24 h水稻幼苗叶片热激蛋白。1 000个可重复蛋白质点中有73个出现差异表达,结果表明一批低分子量的小热激蛋白被诱导,其中低分子量的线粒体sHSP采用Western blotting进一步验证。在mRNA水平上分析了4个差异积累的与抗氧化酶相关的蛋白点,但蛋白丰度与基因表达并不完全相关。 这些结果说明植物以复杂的方式对热胁迫产生应答,而HSPs在复杂的细胞网络中起到主导作用。 Ahsan等应用比较蛋白质组学方法研究大豆幼苗在高温下组织特异性蛋白的表达模式，对暴露于高温中的大豆幼苗的叶、茎和根的蛋白质表达谱的变化进行了分析，在热处理下叶，茎，根分别有54，35和 61 个蛋白点表达差异。差异表达热休克蛋白（HSPs）和抗氧化的蛋白质大部分是上调表达，而与光合作用、次生代谢及氨基酸和蛋白质合成相关的蛋白表达量下调，低分子质量的 HSPs和HSP70在所有组织中上调表达，蛋白质组学分析及免疫印迹分析表明 HSP70、CPN-60β和 ChsHSP 的应答具有组织特异性。 这些结果表明，为了应对高温胁迫，大豆幼苗进行了组织特异性的应答调节，组织特异性蛋白质可能在特定组织对应热胁迫应答中起到至关重要的作用。 在小麦的生育期特别是灌浆期时高温将会影响蛋白质的合成及蛋白质组分，进而影响小麦的磨粉和面筋强度等加工品质。Skylas等对两个小麦品种(耐热品种 Fang和不耐热品种 Wyuna)在开花后15d、16d、17d、进行 40℃和 25 ℃(对照为 24 ℃和18 ℃）处理开花后 17d和成熟的子粒利用面团品质测验和蛋白质组方法分析热胁迫的效应。 耐热品种 Fang的面团强度在高温处理后增加，而不耐热品种 Wyuna的面团强度在高温处理后降低。 盐胁迫是目前仅次于干旱胁迫增加最快的非生物胁迫因子之一,盐胁迫会引起水分亏缺、离子毒害,导致分子损伤、生长和产量降低,严重限制农业生产。 Ramani和Apte研究了水稻幼苗盐胁迫下多基因的瞬时表达,发现至少有35个蛋白质被盐胁迫诱导和17个蛋白质被抑制,包括20个首次报