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第五章转录2
第三节 DNA的修复系统 一、复制修复 1、尿嘧啶糖基酶系统: 能切除进入DNA的尿嘧啶核苷酸。 1、尿嘧啶糖基酶系统的作用过程 i)糖基酶识别错配位点,并制造AP位点。 ii)AP内切酶切除相邻核苷酸。 iii)DNA 聚合酶修补缺口。 iv)DNA 连接酶连接缺口。 U AC AGT TGGTCA glycosylase C AC AGT TGGTCA TGGTCA AC AGT TGGTCA ACCAGT AP endonuclease DNA polymerase DNA ligase 第三节 DNA的修复系统 一、复制修复 1、尿嘧啶糖基酶系统: 能切除进入DNA的尿嘧啶核苷酸。 2、错配修复: 错配修复(mismatch repair) 1. 修复系统 识别错配的碱基对,准确地区分出哪一个碱基是错误的,切除错误碱基,并进行修复 TACGTACGCACG ATGCATGCATGC Which is wrong,A or C? 2. E. coli中的DNA甲基化酶 dam甲基化酶( Adenine methylase) 复制 甲基化 新合成的链未甲基化修饰 半甲基化 C T A G 复制 错配 识别 剪切 Polymerase I ligase Methylase 3.修复过程 第三节 DNA的修复系统 一、复制修复 1、尿嘧啶糖基酶系统: 能切除进入DNA的尿嘧啶核苷酸。 2、错配修复: 首先识别母链和有错配的新链;在新链上打开缺口;外切错配片段,填补上正确序列,封闭缺口。 3、无嘌啉(AP)修复: 无嘌啉内切酶(AP内切酶)能切除DNA中无碱基核糖,留下一段单链DNA,然后填补封闭。 二、损伤修复 1、光复活: 是对UV诱发的T-T二聚体。修复发生在320-370nm的蓝光中。 (1)修复酶: 光复活酶(photoreactivation enzyme, PRE) (2)修复机理 PRE被光子激活,直接切断T-T之间的交联键。 二、损伤修复 1、光复活: 光复活酶(PR酶):修复嘧啶二聚体。 2、甲基转移酶: O6-G→G。(以免O6-G 与T配对) 3、切除修复:核酸内切酶UreABC识别切除损伤DNA片段;DNA聚合酶合成一段新链置换损伤片段,连接酶封闭。 1. 光修复 是对UV诱发的T-T二聚体。修复发生在320-370nm的蓝光中。 1949年Albert Kelner发现的。 (1)修复酶: 光复活酶(photoreactivation enzyme, PRE) (2)修复机理 PRE被光子激活,直接切断T-T之间的交联键。 UvrA UvrB UvrC OH P DNA聚合酶Ⅰ OH P 3、切除修复 是细胞内最重要的修复机制 ,主要由DNA聚合酶Ⅰ和 连接酶完成。 DNA连接酶 ATP E.coli的切除修复机制 i)糖基酶识别错配位点,并制造AP位点。 ii)AP内切酶切除戊糖。 iii)DNA 聚合酶修补缺口。 iv)DNA 连接酶连接缺口。 U AC AGT TGGTCA glycosylase C AC AGT TGGTCA TGGTCA AC AGT TGGTCA ACCAGT AP endonuclease DNA polymerase DNA ligase 3.1 碱基切除修复 (1)识别损伤处 修复T-T dimer导致的结构变形。 内切酶uvrABC识别。 (uvr:Ultraviolet repair) 3.2 核苷酸切除修复(nucleotide excision repair,NER) ①uvrAB识别嘧啶二聚体或其他大的损伤。 ②然后uvrA脱离。 T-T AA T-T AA uvrA uvrB T-T AA uvrC uvrB (3)释放单链片断 uvrD是一种解旋酶,把切开的部位解螺旋,释放出单链片断(约12nt)。 T-T uvrD AA 5’ 3’ uvrC与uvrB结合,并在损伤点两侧(5‘端7nt、3’端3-4nt)切断单链。 (2)切割 (5)连接 DNA ligase连接成完整的链。 AA ligase TT (4)修补 DNA polymerase Ⅰ填补缺口。 AA Pol Ⅰ 三、复制后修复 1、重组修复 2、SOS修复 只有当DNA损伤后才激活SOS修复系统。 SOS系统使复制叉跳过损伤区域继续合成DNA链。 SOS修复中,损伤的模板不能正确复制,而且DNA多聚酶的校正系统放松了对错误核苷酸的识别,所以产生的DNA分子往往是无功能的。故被称为差错倾向修复。 Miroslav Radman首先在切除修复缺陷型菌株中发现的。 1. 重组修复(recombi
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