生物化学生物信息的传递上从dna到rna.ppt

第三章 生物信息的传递（上）－从DNA到RNA 3.1 RNA的转录 3.2 启动子与转录起始 3.3 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 3.4 终止与抗终止 3.5 内含子的剪接、编辑及化学修饰 DNA序列是遗传信息的贮存者，它通过自主复制得到永存，并通过转录生成信使RNA、翻译生成蛋白质的过程来控制生命现象。 3.1 RNA的转录 3.1.1 转录的基本过程 无论是原核还是真核细胞，转录的基本过程都包括:模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止。 RNA链的延伸图解 3.1.2 转录机器的主要成分 3.1.2.1 RNA聚合酶 E. coli RNA polymerase RNA合成过程 3.1.2.2 转录复合物 3.2 启动子与转录起始 大肠杆菌RNA聚合酶与启动子的相互作用主要包括 RNA聚合酶保护法 原核生物启动子 －35区：一致性序列为TTGACA 是RNA-pol的辨认位点 －10区：一致性序列为TATAAT 又叫Pribnow盒 是RNA-pol的结合位点 真核生物启动子 E.Coli各σ识别的启动子的序列 由含?70RNA多聚酶全酶识别的典型大肠杆菌启动子 3.2.2 启动子区的识别 在启动子区DNA双螺旋结构中，腺嘌呤、鸟嘌呤和胞嘧啶上的某些基团是氢键供体，而4种碱基中的某些基团是氢键受体。由于它们分别处于DNA双螺旋的大沟或小沟内，因此都具有特定的方位，而酶分子中也有处于特定空间构象的氢键受体与供体，当它们与启动子中对应的分子在一定距离内互补时，就形成氢键，相互结合。 3.2.3 酶与启动子区的结合 在RNA聚合酶与启动子相互作用的过程中，聚合酶首先与启动子区闭合双链DNA相结合，形成二元闭合复合物，然后经过解链得到二元开链复合物。解链区一般在-9～+13之间，而酶与启动子结合的主要区域在其上游。 3.2.4 -10区和-35区的最佳间距 在原核生物中，-35区与-10区之间的距离大约是16～19bp 3.2.5 增强子及其功能 增强子的发现从SV40开始，在SV40的转录单元上发现它的转录起始位点上游约200bp处有两段72bp长的重复序列，它们不是启动子的一部分，但能增强或促进转录的起始，除去这两段序列会………….若保留其中一段或将之取出插至DNA分子的任何部位，就能…………………… 3.2.6 真核生物启动子对转录的影响 启动子是确保转录精确而有效地起始的DNA序列。 1979年，美国科学家Goldberg首先注意到真核生物中，由RNA聚合酶II催化转录的DNA序列5′上游区有一段与原核生物Pribnow区相似的富含TA的保守序列。由于该序列前4个碱基为TATA，所以又称为TATA区(TATA box)。 三、真核生物的转录过程 　 参与RNA-pol Ⅱ转录的TFⅡ 3.3 原核生物与真核生物 mRNA的特征比较 3.3.1 原核生物mRNA的特征 细菌基因的转录与翻译是紧密相联的，基因转录一旦开始，核糖体就结合到新生mRNA链的5′端，启动蛋白质合成，而此时该mRNA的3′端还远远没有转录完全。在电子显微镜下，我们可以看到一连串核糖体紧紧跟在RNA聚合酶后面。 原核细胞mRNA的结构特点 S-D序列 3.3.2 真核生物mRNA的特征 真核生物的mRNA(不包括叶绿体和线粒体)5′端都是经过修饰的，基因转录一般从A起始，第一个核苷酸保留了5′端的三磷酸基团并能通过其3′-OH位与下一个核苷酸的5′磷酸基团形成二酯键，转录产物的起始序列为pppApNpNp…… 除组蛋白基因外，真核生物mRNA的3′末端都有poly(A)序列，其长度因mRNA种类不同而变化，一般为40～200个。 poly(A)序列是在转录后加上去的，是在细胞核中的不均一核RNA阶段加上的。 真核细胞mRNA的结构特点 ? 抗终止的机制 依赖于噬菌体本身的依赖ρ因子的终止子 依赖ρ因子的终止子上游有抗终止信号(靠近PL 的nutL，靠近tR1的nutR nut—PN utilization) 抗终止蛋白和nut位点的结合，等待RNApol经过 时修饰RNApol的构象，拮抗寄主编码的终止蛋白ρ的活性,使之通过那些依赖ρ的终止子 3.5 内含子的剪接、编辑及化学修饰 3.5.l RNA中的内含子 真核基因表达往往伴随着RNA的剪接过程,从mRNA前体分子中切除被称为内含子(intron)的非编码区，并使基因中被称为外显子(exon)的编码区拼接形成成熟mRNA。 3.5.2 RNA的剪接 许多相对分子质