第二章 核酸201102.ppt

第二章 核酸的结构和类型 Structures and Types of Nucleic Acid DNA和RNA 第一节 核酸的结构 一、核酸的化学组成 核酸（nucleic acid）是一个线性生物大分子 = N 核苷酸 （nucleotide） = N（核苷nucleoside+磷酸基团Phosphate ） = N（碱基base+戊糖pentose+磷酸基团） = 也就是N（腺嘌呤or鸟嘌呤or胞嘧啶or胸腺嘧啶or尿嘧啶 +核糖or脱氧核糖 + 磷酸基团） = 英文缩写为N（A, G, C, T，U + ribose or deoxyribose + Phosphate） 核酸的线性分子（DNA的双螺旋） 核苷酸的结构 戊糖的结构 嘌呤的结构 嘧啶的结构 二、核酸分子内的连接 呋喃型戊糖有1 ′ ，2 ′ ，3 ′ ，4 ′ ，5 ′个碳原子。在核酸分子中与碱基和磷酸基团主要有五种连接方式： （一）连接1：戊糖与碱基相连 在碳1原子，戊糖通过β-糖苷键(glycosidic bond)连接碱基。连接嘧啶的1位或嘌呤的9位。 二、核酸分子内的连接 磷酸二酯键连接不同的核苷酸： （二）连接2：碳3上的羟基与其它核苷酸的磷酸基团通过磷酯键连接。 （三）连接3：碳5上的磷酸基团与其它核苷酸上戊糖上的3位的羟基通过磷酯键相连。 形成磷酸二酯键（核酸的主要骨架）。 形成5 ′- 3 ′的线性分子。核酸单链一端是5 ′碳原子上带有磷酸基团的核苷酸（称为5 ′ 端），另一端是3 ′碳原子上仍保留游离羟基的核苷酸残基（称为3 ′ 端）。每股核酸都有5 ′和3 ′两个不同的末端，所以核酸分子是有方向性的。 二、核酸分子内的连接 （四）连接4：形成环核苷酸分子。 核苷酸分子内部碳5上的磷酸基团也可与碳3上的羟基形成分子内的磷酯键。如 cAMP和cGMP等。 是重要的信号物质。 环核苷酸的连接 连接5：环腺苷（cAMP）和环鸟苷（cGMP） 腺苷酸环化酶 磷酸二酯酶 腺苷酸——环腺苷——腺苷酸 5 ′碳原子的磷酸基团与3 ′碳原子的羟基环合 cAMP：激活PKA（蛋白激酶A），实现特定蛋白的磷酸化。分解糖原 cGMP：激活PKG。与光信号传递，NO传递途径（调节血管舒张，血小板凝聚）有关。 二、核酸分子内的连接 （五）连接5：核糖核苷酸2 ′上的羟基也可与其他核苷酸的5 ′磷酸基团连接。 形成2 ′- 5 ′的特殊核酸结构，从而引起人体的抗病毒免疫反应（干扰素）。 或者干扰5 ′- 3 ′磷酸二酯键的形成，造成RNA分子断裂，造成RNA分子的不稳定。（为什么用DNA做遗传物质，RNA病毒的变异性强）。 三、碱基的配对 DNA分子中两条链的结合是通过各自碱基相互配对形成的。 碱基配对的原则是：A-T（U），G-C。这就是Watson-Crick配对原则。是分子生物学的奠基石。（后来发现也有一些特殊的配对原则，称为非Watson-Crick配对原则，如Hoogsteen配对原则） 维持碱基配对的力是：氢键和碱基堆积力（轴向相邻的碱基由于具有很强的疏水作用，因此在水相溶液中会自发的堆积在一起，形成碱基堆积力（ 包括范德华力和疏水作用 ），使得核酸形成更为稳定的三维结构。 ）。 三、碱基的配对 A-T（U）为两个氢键。 G-C为三个氢键，更稳定。 碱基的结构与核酸的物理特性 碱基是环状分子，有共轭性（其中多个原子都有形成部分双键的特性，使得碱基有很强的共轭性），因而有光吸收的特性，主要在260纳米附近有强的紫外吸收。 双螺旋在260nm下，有最大吸收。当浓度为50ug/ml时，A=1.00；Tm时， A=1.185；完全变性时， A=1.37；同浓度等比例单核苷酸混合时， A=1.60。DNA变性引起的光吸收度增加称为增色效应。 第二节DNA的结构 DNA的一般结构： 一级结构：核苷酸的排列顺序（碱基的排列顺序）。存储遗传信息。 二级结构：双螺旋结构，不同构象。 三级结构：单链和双链、双链和双链相互作用形成的三链和四链结构。拓扑结构 四级结构：核酸与蛋白相互作用形成的结构。 一、一级结构：遗传信息 核苷酸的排列顺序。 书写方式：ACGTGGCGAT（反映的是核苷酸的5 ′- 3 ′排列顺序） 包含了生命信息的所有内涵（基因和调控基因），是其他结构（二、三、四级）和物质（RNA、蛋白等）的基础。 人类基因组计划的研究目标。 可以通过测序的方式获得。 二、二级结构——DNA不同的构象 A，B，C，D，Z等构象。 DNA的三种构型顶面观 DNA的构象 1、B构象（标准）： 是一般状态下的构象。结构最稳定。