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中药与天然药物研究的创新技术和方法 陈士林 ( 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所 中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室 北京100193) 中药与天然药物研究的创新技术和方法是实现中药现代化必要前提和重要 组成部分，作者针对近年来前沿技术和方法在中药资源、中药鉴定、药用植物基 因组学以及中药化学等领域的应用做一简要介绍。 一、基于“3S” （GIS、RS 、GPS ）技术的中药资源调查及产地适宜性研究 1. 中药资源调查研究：基于多级遥感（Multi-Level RS ）监测体系的中药资 源调查。利用高分辨率低空 遥感数据与中分辨率卫星数据相结合进行空中抽样来估计植物药材面积或蓄积 量。在中分辨率影像上布设高分辨率样地，以样地位置处的高分辨率低空遥感影 像为依据布设地面调查样地，对整个药材分布区进行估计，可充分发挥各级遥感 平台和多种分辨率卫星数据功能，减少经费投入和劳动强度，提高中药资源调查 精度和准确度。 2. 中药材产地适宜性技术：基于GIS 空间技术以及多元统计理论和方法研 发的中药材产地适宜性分析地理信息系统（Geographic Information System for Traditional Chinese Medicine，TCMGIS ），实现了中药材各种数据格式与空间数 据的整合及一体化表达，采用气象数据与土壤数据栅格空间聚类分析方法，对中 药材在全国范围内进行了生态适宜区筛选和评估，实现了中药材新产地选择的数 值模拟和定量评价。 二、基于DNA 条形码技术的中药鉴定创新方法 DNA 条形码是利用基因组中标准的、相对较短的DNA 片段来进行物种鉴定 的分子诊断新技术和方法，已成为生物分类和鉴定的研究热点和新方向。近年来， 中药DNA 条形码分子鉴定得到快速发展，在中药基原及中药材鉴定等方面均取 得了突出成绩，促进了中药标准化鉴定的进程。本课题组自2006 年开始进行DNA 条形码鉴定研究，通过对6000 余份药用植物样本进行DNA 条形码序列筛选， 1 表明 ITS2 序列的鉴定能力优于国际条形码协会植物工作组推荐的 matK ＋rbcL 组合，首次提出将ITS2 序列作为药用植物鉴定的通用 DNA 条形码，并建立了 以ITS2 为核心，psbA-trnH 为补充序列的药用植物DNA 条形码鉴定体系。同时， 验证了ITS2 对蔷薇科、大戟科、菊科、豆科等多个科属密切相关种的鉴定能力。 进一步研究表明ITS2 在大于5 万份植物样本和大于 1 万份动物样本中均具有较 强的鉴定能力，从而为药用动物通用DNA 条形码COI 提供了补充条形码序列， 并构建了COI+ITS2 药用动物联合DNA 条形码鉴定体系以及ITS2 用于物种鉴 定的国际网站，为中药材DNA 条形码鉴定的实施奠定了坚实基础。 三、基于新一代高通量测序技术的药用植物基因组学研究 药用植物次生代谢的途径和调控以及种类和合成方式呈现丰富性、复杂性和 多样性，目前的模式生物无法满足研究的需要。课题组从2009 年启动了本草基 因组计划（Herb Genome Program, HerbGP ），该计划是针对具有重要经济价值的 药用植物和代表不同次生代谢途径的模式药用植物开展的基因组系列研究计划， 主要内容包括全基因组序列的测定、组装和生物信息学分析，及具有典型次生代 谢途径的模式药用植物研究平台的建立和抗病抗逆等优良性状遗传机制的阐明 等后基因组学研究。利用二代测序技术平台对药用植物叶绿体基因组、转录组、 全基因组等进行研究。目前已获得银杏、玉兰、红豆杉和苏铁等26 个物种的叶 绿体基因组图谱；完成人参、三七、西洋参、丹参、甘草、红豆杉、银杏等 13 个药用植物和赤芝的转录组研究，以及赤芝、紫芝、茯苓的全基因组测序、组装、 及生物信息学分析。丹参的基因组框架图已完成，人参全基因组测序正在进行中。 已发现了一系列与灵芝酸、人参皂苷、甘草酸、石松碱、丹参酮、绿原酸等有效 成分合成及代谢相关的基因。为次生代谢产物的生物合成和代谢工程，及优质高 产药用植物品种的选育奠定了坚实的基础。 四、中药化学成分提取与分离的新