祼子植物的分子系统发育、分歧时间估计和适应性选择检测.pdfVIP

目录 摘要 … …… …… ……i 第一章引言 … … … … 1 1．1分子系统发育分析方法与存在的问题 … ．．… l I l l物种树与基因树… …． …．… …… …．2 1I … 2物种树与基因树不一致的原因 一… ……4 1l3从基因树估计物种树 … … … ………8 ¨4系统发育分析的常用软件 …… … … … 19 】2系统发育分歧时间估计 … …．… 2l 121分歧时间估计原理与算法 … …… 22 1．2．2分歧时间估计常用软件 ………．．… … ……23 l3适应性进化捡袒j…… … 24 1 31分子进化的中性学说 ……一 … ……24 1 3．2适应性进化检测的原理和方法 ……… ……25 1．33检测适应性进化的常用软件 …… … …………26 1 4裸子植物分子进化研究 … ……… 27 I41裸子植物的系统发育 …… … 27 l 4．2现阶段裸于植物系统发育研究存在的主要问题… 30 I 43本研究的目的 ．．．．… … … ………31 第二章裸子植物的分子系统发育… … … ……32 21植物材料 … ． … ．35 22实验仪器、试剂投其来源… …… 35 2．2I实验仪器 …… … … …… … 35 2．22试剂 … …… ……39 2．3实验方法 … … … 40 2．31溶液配置… …… … 40 232DNA提取、扩增及回收删序 … …41 2．4数据分析与应用软件 … …… …… 47 2．5结果 … … 53 2．51 Modehest检钡9结果