lncRNA(完成版).ppt

Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 Outlines lncRNA的定义 lncRNA的来源 lncRNA的分类 lncRNA的功能及作用分析 lncRNA对基因的调控 lncRNA与临床疾病 1.LncRNA 的转录可以干扰邻近基因的表达 * 人类细胞中的细胞周期蛋白D1(CCND1)的表达, DNA损伤信号诱导该基因启动子上游一段lncRNA的表达,它可调节RNA结合蛋白--TLS的活性,接着TLS抑制CREB结合蛋白和p300的活动,进而使CCND1基因的表达沉默 2.LncRNA可作为共因子调节转录因子的活性 * 例如,小鼠的一段lncRNA--Evf2转录自一段超保守的远端增强子,它可与转录因子DLX2形成转录复合体, 并结合至一个增强子上,从而诱导邻近蛋白编码基因DLX6的表达。 通过与影响启动子选择的抑制性复合物相互作用,封锁启动子区域来调控RNA聚合酶(RNA P)的活动从而干扰基因表达,这可能是存在于真核细胞染色体上的上千种三倍体复合物结构控制启动子作用的普遍机制。 三、转录后调控 *
LncRNA在转录后水平可与mNRA形成双链RNA复合物,以掩盖mRNA的主顺式作用元件,从而调控基因表达。 例如,lncRNA-Zeb2(即Sip1)能够和HOX位点转录的mRNA的一 个内含子的5端剪切位点形成双链[26],从而防止该内含子被剪切(图2E)。该区域含有对于Zeb2蛋白表达所必须的核糖体结合点,Zeb2通过这种方式能够提高Zeb2蛋白的表达量。 这一例子说明lncRNA可以指导mRNA亚型的选择性剪接。 * 另外,lncRNA的复性(退火)具有靶向作用,使蛋白受体复合物能够识别正义链mRNA转录本,这一作用类似于RNA诱导的沉默复合物(RISC)通过siRNA靶向作用于mRNA 。 来自于互补转录本甚至是lncRNA的双链RNA,结合延长的内部发夹结构,能够被加工成内源性siRNA以使基因表达沉默。 * * 长链非编码RNA A. 是一类转录本长度超过 200 nt(核苷酸单位 )的功能性 RNA 分子[1]; B. 位于细胞核或胞质内; C. 它们缺乏编码蛋白的能力; D. 以 RNA 形式在多种层面上 (如表观遗传学、转录调控及转录后调控等方面 )调控基因的表达水平。 lncRNA的定义 编码蛋白质的基因结构发生中断而转变成 lncRNAs A 染色质重组的结果，即两个未转录的基因与另一独立的基因并排重组而产生含多个外显子的 lncRNAs B 非编码基因复制过程中的反移位产物 C 局部的串联复制子邻近产生 D 基因组中插入一个转座成分而产生有功能的非编码 RNA E 据其在基因组上相对于蛋白编码基因的 位置 lnc RNA 正义 双向 基因间 反义 antisense sense intergenic bidirectional intronic * lncRNA 起初人们认为 RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物 无生物学功能 基因转录的 “噪音” JUNK DNA!! lncRNA的功能 * 近期研究表明众多lnc RNA具有多种生物学功能 1.参与X染色体沉默、基因组印记、染色质修饰、 转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要调控过程。 2. 以多种模式保护蛋白编码基因:如受到严格的功能限制以保护编码基因的开放式可读框(ORF);或表现为基因序列的较短延伸,以保护功能域和结构。 lncRNA的功能 * 3.Lnc RNA含有高效的关键序列, 类似于启动子等调控因素, 具有比蛋白质更敏感的结构功能限制。 4. 一些进化后的人类基因保守区域可被转录成lncRNA,如HAR1[8],在大脑皮质发育阶段早期神经元内表达。 lncRNA的功能 * 5.研