苋菜amaag基因克隆与生物信息学分 析.pdfVIP

－ 江西农业大学学报　 ２０１７，３９（１）：１６８ １７４ ｈｔｔｐ：／ ／ ｘｕｅｂａｏ．ｊｘａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ Ａｃｔａ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｅ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔａｔｉｓＪｉａｎｇｘｉｅｎｓｉｓ ＤＯＩ：１０．１３８３６／ ｊ．ｊｊａｕ．２０１７０２２ － 柳燕，谢礼洋，赖钟雄，等．苋菜ａｍａＡＧ基因克隆与生物信息学分析［Ｊ］．江西农业大学学报，２０１７，３９（１）：１６８ １７４． 苋菜ａｍａＡＧ基因克隆与生物信息学分析 ∗ ∗ 柳　 燕，谢礼洋，赖钟雄 ，刘生财 （福建农林大学 园艺植物生物工程研究所，福建 福州 ３５０００２） 摘要：以苋菜种子为初始材料，通过离体培养获得苋菜各阶段试管苗，利用实验室构建的苋菜开花过程转录组 数据库（ＮＣＢＩ ＳＲＡ ｎｕｍｂｅｒ：ＳＲＲ９２４０８９，ＳＳＲ９２４０９０，ＳＲＲ９２４０９１，ＳＲＲ９２４０９２），采用ＲＴ⁃ＰＣＲ结合ＲＡＣＥ技术进 行ａｍａＡＧ基因全长ｃＤＮＡ 序列克隆，然后对其进行生物信息学分析。 结果表明，苋菜 ａｍａＡＧ基因全长为 １ １２３ ｂｐ，其中５′ＵＴＲ １２２ｂｐ，３′ＵＴＲ２４３ｂｐ，ｐｏｌｙＡ尾长１７ｂｐ，并包含一个７４１ｂｐ 的开放阅读框，编码２４６个氨 － 基酸。 通过生物信息学分析可知，该蛋白属于亲水蛋白，但不是稳定蛋白；属于ＭＡＤＳ和Ｋ ｂｏｘ超级家族，包 － 含ＭＡＤＳ＿ＭＥＦ２ ｌｉｋｅ和Ｋ⁃ｂｏｘ功能位点，与植物开花相关。 ａｍａＡＧ基因差异表达分析表明，该基因是在开花期 表达量最高。 说明本研究已获得了苋菜ａｍａＡＧ基因，这为将来深入研究其功能奠定了基础，也为研究苋菜开 花分子机制提供参考。 关键词：苋菜；ＡＧ基因；克隆；开花；生物信息学 － － － 中图分类号：Ｓ６３６．４　 　 文献标志码：Ａ　 　 文章编号：１０００ ２２８６（２０１７）０１ ０１６８ ０７ Ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ａｍａＡＧ ｉｎＡｍａｒａｎｔｈｕｓ ｔｒｉｃｏｌｏｒ Ｌ． * ∗ ＬＩＵ Ｙａｎ，ＸＩＥ Ｌｉ⁃ｙａｎｇ，ＬＡＩ Ｚｈｏｎｇ⁃ｘｉｏｎｇ ，ＬＩＵ Ｓｈｅｎｇ⁃ｃａｉ （Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｆｕｊｉａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ ａｎｄ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｆｕｚｈｏｕ ３５０００２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅ ｓｅｅｄｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｃｕｌｔｕｒｅ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ｐｌａｎｔｌｅｔｓ ｏｆＡｍａｒａｎｔｈｕｓ ｔｒｉｃｏｌｏｒ ａｓ ｔｈｅ ｍａｔｅｒｉａｌ．Ｔｈｅ ｆｕｌｌ⁃ｌｅｎｇｔｈ ａｍａＡＧ ｃＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｗａｓ ｃｌｏｎｅｄ ｕｓｉｎｇ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｄａｔａｂａｓｅ ｏｆ Ａ．ｔｒｉｃｏｌｏｒ （ＮＣＢＩ ＳＲＡ ｎｕｍｂｅｒ：