猪繁殖及呼吸综合征病毒江苏分离株ORF5及Nsp2基因部分序列分析.pdfVIP

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2017-07-04 发布于北京
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猪繁殖及呼吸综合征病毒江苏分离株ORF5及Nsp2基因部分序列分析.pdf

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2010 2 30 2 Chin Vet Sci Feb. 2010 Vol. 30 No. 2 145 ORF5 Nsp2 1, 2 1 1 1* 1 迟兰 , 崔盟 , 王寿利, 吴艳涛 , 刘秀梵 ( 1. , 225009; 2. , 221006) : 对2006) 200 年分离于江苏省部分发病猪场的 PRRSV, 采用 RT- PCR 技术, 行 ORF5 基因序列以及 Nsp2 基因部分序列的扩增克隆并测序应用DNAStar 软件将测序结果与已发表的国内外参考毒株行比对分析结果表明, 分离的21 株病毒ORF5 基因大小均为603 bp; 与国内分离株之间同源性为 8 . % ~ 9 1 0% , 与国外美洲型分离株同源性为 85. 6% ~ 90. 5% ; 21 株 PRRSV 分离株与欧洲型毒株之间的同源性仅为 54. 1% ~ 561 6% 14 株用于扩增Nsp2 基因部分序列的PRRSV 在全基因组第2 8~ 2 80 位及第2 94 ~ 3 033 位分别缺 3 个和8 个碱基, 其中的2 个江苏扬州分离株在第2 4 ~ 2 836 位又缺失了 90 个碱基; 14 个毒株之间同源性为 931 2% ~ 991 0% , 与VR-2332 相比同源性为 4. 9% ~ 8. 5% , 与国内河北河南等地2006 年的 PRRSV 分离株相比同源性为94. 1% ~ 99. 1% :猪繁殖与呼吸综合征病毒; ORF5; Nsp2; 序列分析 : S852. 6; S852. 659. 6 : A : 1005-4545( 2010) 02-0145-05 Sequence analysis of PRRSV (Jiangsustrains) ORF5 and partial of Nsp2 gene 1, 2 1 1 1* 1 CHI Lan , CU I M eng , WANG Shou-li , WU Yan-tao , LIU Xiu-fan ( 1. K ey L abor atory of A ni- mal I nf ectious Disease of Ag ricultur al Ministry , Yangz hou University , Yang z hou, iangsu 225009, China; 2. X uz hou H ig her Prof essional S chool of B ioengineer ing , X uz hou, iangsu 221006, China) Abstract: ORF5 of 21 PRRSV isolates from Jiangsu province of China in 2006-200 and Nsp2 gene of 14 isolates were amplified by RT-PCR.T he PCR products were cloned and sequenced.The results show ed that ORF5 gene of all the isolates w ere 603 bp in length.T he 21 isolates had an identit y of 98. 5%- 1001 0% , simultaneously had an identity of 8 . %-9 1 0% and 85. 6%-90. 5% w ith domestic isolations and American strains, respect ively. the 21 isolates has an identity of 54. 1%-56. 6% with European strains. According