血清蛋白质组学.PPT

前基因组时代的“钓鱼”和后基因组时代的“捞鱼” 思考题 RPLC分离时为什么要分别用大小孔的填料？为什么反相流动相要加TFA？ 血清预处理中加入脲的作用是什么？SEC分离时，先出峰时分子量大的还是小的？基质的作用？ 用SEC/RPLC/-MS研究蛋白质组学有什么优点？ 除了本实验介绍的方法还可以用什么方法用来研究蛋白质组学？除质谱外，还有什么方法可以作为最终鉴定方法？ 参考文献 Tirumalai R S, Chan K C, Prieto D A, et al. Characterization of the Low Molecular Weight Human Serum Proteome. Mol Cell Proteomics, 2003 , 2:1096-1103 Yu K H, Rustgi A K, Blair I A. Characterization of Proteins in Human Pancreatic Cancer Serum Using Differential Gel Electrophoresis and Tandem Mass Spectrometry. J Proteome Res, 2005, 4: 1742-1751 宋鑫, 杨金亮, 魏于全. 血清蛋白质组学的研究进展. 四川医学, 2005, 26(7): 717-719 Finke B, Mank M, Daniel H, et al. Offline coupling of low-pressure anion-exchange chromatography with MALDI-MS to determine the elution order of human milk oligosaccharides. Anal Biochem, 2000, 284: 256-265 Nyman T A. The role of mass spectrometry in proteome studies. Biomol Eng, 2001, 18: 221-227 Gareaa A V, Grieseb M and Imhof A. Biomarker discovery from body fluids using mass spectrometry. J Chromatogr B, 2007, 849: 105-114 Montaudo G, Samperi F, Montaudo M S. Characterization of synthetic polymers by MALDI-MS. Prog Polym Sci, 2006, 31: 277-357 大肠杆菌表达重组人粒细胞-集落刺激因子包涵体的复性与纯化 化学生物学实验课程组 王骊丽 实验四 请预习下一个实验 1995年，流感嗜血杆菌；1997年，酵jiao母；1998年，线虫；2000年，果蝇；2001年，人类；2002，水稻以及后来的岭南芥和小鼠的全基因组测定都已经陆续完成，人们开始拥有了大量的基因信息，为基因组和蛋白组研究打下坚实的基础。 好处：所有被编码的蛋白都可以被预测和鉴定；遗漏的功能可以被鉴定和分析；可以 研究各个肌体中的特性和新颖性；可以进行预测和评价。 多维色谱与MALDI-TOF MS联用技术 对人血清中低丰度蛋白的分离与鉴定 《化学生物学》实验课程组 白 泉 实验三 创新实验I-化学生物学 化学国家级实验教学示范中心 NORTHWEST UNIVERSITY 蛋白质组学：概念、血清蛋白质组学、比较蛋白质组学 蛋白质分离技术平：二维电泳、多维液相色谱 蛋白质鉴定技术：生物质谱，LC-ESI MS, MALDI-TOF MS，肽质量指纹鉴定蛋白质技术、串联质谱数据鉴定蛋白质技术 生物信息技术：生物信息学、数据库的建立、网站和数据库 实验技能训练要点 主要新知识 仪器分析：色谱技术 –快速蛋白质纯化仪、SEC、RPLC 、质谱技术-MALDI-TOF MS …… 化学生物学导论：蛋白质、酶…… 蛋白质与酶化学：蛋白质、酶…… 蛋白质纯化与表征：液相色谱法、电泳、质谱….. Your site here LOGO 实验技能训练要点 主要知识回顾 1995，流感嗜血杆菌1830 Kb 1997，酵母 12.7 Mb 1998，线虫9700 Kb 2002，水稻 ~430 Mb 2001，人 ~3 Gb 2000，果蝇 137 Mb 背景知识 关键词：蛋白质组学、多维液相色谱、生物质谱 Proteomics, Multidimensional liquid chromatography, Biological mass spectrometry 什