结构化学上机实验二.pdf

结构化学上机实验二 题目： 1．通过理论计算（半经验，从头算，密度泛函理论）比较顺、反丁二烯的稳定性。 2 ．通过理论计算（半经验，从头算，密度泛函理论）证明丁二烯可以有1，4 加成反应。 3 ．通过理论计算（半经验，从头算，密度泛函理论）证明环丁二烯不具有共轭性。 提示： 方法关键词： 半经验： # PM3 OPT 从头算： # HF/STO-3G OPT 密度泛函理论： # B3LYP/STO-3G OPT 可以做表格比较以说明问题： 表1 丁二烯的总能量(单位：hartree) 顺式丁二烯 反式丁二烯 PM3 x.xxxxx x.xxxxx HF/STO-3G x.xxxxx x.xxxxx B3LYP/STO-3G x.xxxxx x.xxxxx 从表1 可知，反式丁二烯的总能量低于顺式丁二烯的总能量，说明反式丁二烯比顺式丁 二烯稳定。 表2 丁二烯的键长参数（单位：埃） 顺式丁二烯 反式丁二烯 C1-C2 a.aaa c.ccc C2-C3 b.bbb d.ddd 从表2 可知，C1-C2 键长比标准的CC 双键键长(1.337 埃)长，C2-C3 键长比标准的CC 单键键长(1.54)短，说明出现了共轭效应，因此丁二烯会发生1，4 加成反应。 表3 环丁二烯的键长参数（单位：埃） C1-C2 C3-C4 PM3 x.xxxxx x.xxxxx HF/STO-3G x.xxxxx x.xxxxx B3LYP/STO-3G x.xxxxx x.xxxxx 从表3 可知，C1-C2 键长接近于标准的CC 双键键长(1.337 埃)，C2-C3 键长接近于标准 的CC 单键键长(1.54 埃)，说明环丁二烯没有共轭效应。 注意： 1．本实验需要软件：GaussView （建模型，看结构及结果）；G09W （计算）；molden （建模型、看结构及结果，分子轨道） 2 ．部分电脑不能使用GaussView，原因可能是显卡驱动没安装好，请换一台电脑。 3 ．输入、输出文件请保存到d 盘，gaussview 不支持中文路径及中文文件名。 4 ．键长的数据可以用GaussView 读取优化过的输出文件，并测量得到。 5 ．G09W 正常结束的标志是在输出文件的最后可以看到这样一句“Normal termination of Gaussian ….”。请确认你的计算正常结束后，再比较结构参数（键长，键角，二 面角等），否则可能得到错误信息。 6 ．体系的总能量，请查询结果文件（*.out），在文件的最后会找到“HF=x.xxxxx ”，这 就是总能量，单位：hartree( 1 Hartree = 627.5095 千卡/摩尔)。 7 ．同学们也可以比较不同方法得到的结果，说明哪种方法更可靠。