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生化第1章蛋白质结构与功能(已看)汇编
本章要点: 1. 20种 L-α- 氨基酸 2. 氨基酸的等电点、紫外吸收性质 3. 肽键、肽键的性质 4. 蛋白质的结构:一级结构和空间构象 5. 结构与功能的关系 6. 蛋白质的等电点、紫外吸收、变性 protein .amino acid. isoelectric point peptide bond .polypeptide chain conformation motif domain denaturation * 第五节 蛋白质的理化性质 及其分离纯化 * 一、两性解离和等电点 P COOH NH3+ P COO- NH3+ P COO- NH2 OH- H+ OH- H+ 阳离子 两性离子 阴离子 (pHpI) (pH=pI) (pHpI) * 二、蛋白质的变性(denaturation) (一)蛋白质的变性定义 天然蛋白质因受物理、化学因素的影响,使蛋白质分子的构象发生了异常变化,从而导致生物活性的丧失以及物理、化学性质的异常变化。但一级结构未遭破坏,这种现象称为蛋白质的变性。 * 三、紫外吸收特性 蛋白质在远紫外光区(200~230nm)有较大的吸收,在280nm有一特征吸收峰,可利用这一特性对蛋白质进行定性定量鉴定。 * 思考题: 1. 何为氨基酸的等电点? 2. 何为肽键?其有何特点? 3. 什么是蛋白质的一级结构?其维系键是什么? 4. 什么是蛋白质的二级结构?它主要有哪几种? 各有何结构特征? 5. 什么是蛋白质的三级结构?其维系键是什么? 6. 举例说明蛋白质的一级结构、空间结构与功能的关 系。 8. 何为蛋白质变性?变性蛋白有何特征? * * * * 1. ?螺旋 (?-helix) 1950年美国Pauling等人在研究纤维状蛋白质时,提出了α螺旋,后来发现在球状蛋白质分子中也存在α螺旋。 (1) 右手螺旋,每圈含3.6个aa,螺距为0.54 nm (2) 链内氢键维持螺旋稳定 (3) 侧链R分布在螺旋外侧 * 2. ?片层/ ?折叠(?-sheet) 也是 Pauling 等人提出来的,它是与α螺旋完全不同的一种结构。 β折叠主链骨架以一定的折叠形式形成一个折叠的片层。 (2) 链间氢链维持稳定。 (3) β折叠有平行和反平行的两种形式 (4) 侧链向片层上下伸出 * 肽链回折180°,使得氨基酸残基的C=O和与第四个残基的N-H形成氢键。 β转角都在蛋白质分子的表面 3. ? 转角( ? -turn) * 4.无规卷曲或自由回转 (non-regular coil) 肽段在空间的不规则排布称为无规卷曲。 没有一定规律的松散肽链结构,但仍是有序的稳定结构。 图1 泛素的空间构型(来自wilkinson lab page) 泛素的二级结构包括?-螺旋(23-34残基)、一个短而伸展的3.10螺旋(56-59)和5片?-折叠,一面?-折叠占统治地位,相对的一面主要为?-螺旋。 * 超二级结构(supersecondary structure) 蛋白质中相邻的二级结构单位(?螺旋或?折叠或?转角)组合在一起,形成有规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合体。 * 模体 在许多蛋白质分子中,2个或多个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,并发挥专一的功能,被称为模体(motif) Zn Cys His * 三、三级结构(tertiary strucure) 指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,即整条肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 * 三级结构的特征: 含多种二级结构单元; 有明显的折叠层次; 是紧密的球状或椭球状实体; 分子表面有一空穴(活性部位); 疏水侧链埋藏在分子内部, 亲水侧链暴露在分子表面。 实例:肌红蛋白 * 结构域(domain) 多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,形成两个或多个在空间上可以明显区别的局部区域,具有独特的空间构象,承担不同的生物学功能 * 维持三级结构的化学键 氢键 疏水作用 离子键 范德华力 二硫键 次级键 非共价键 * NH3 + - O O=C O O C O H S S CH CH2 CH3 CH3 CH3 CH3 CH2 CH CH3 CH3 CH2OH CH2OH C-NH2 NH3 O C=O + - 离子键; 氢键; 疏水力
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