生物胁迫相关NAC 1转录因子的生物信息学分析.pdfVIP

江苏农业科学 ２０１６年第４４卷第１０期 —４３ — 朱 峰，陈孝仁，钱 坤，等．生物胁迫相关ＮＡＣ１ 转录因子的生物信息学分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１６，４４（１０）：４３ ４９． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２ １３０２．２０１６．１０．０１０ 生物胁迫相关 ＮＡＣ１ 转录因子的生物信息学分析 朱 峰，陈孝仁，钱 坤，纪兆林，孔维文，杨益众 （扬州大学园艺与植物保护学院，江苏扬州２２５００９） 摘要：植物ＮＡＣ１ 转录因子在调控植物的抗生物胁迫反应中起着重要的作用。为探究生物逆境相关ＮＡＣ１ 转录 因子的功能，通过生物信息学的方法对８个生物逆境胁迫相关ＮＡＣ１ 蛋白氨基酸序列一致性、氨基酸组成、理化性质、 亲／疏水性、保守结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构及三级结构等进行了预测和分析。结果表明，８个生物逆 境胁迫相关ＮＡＣ１ 蛋白Ｎ 端保守性较强，包括５ 个保守的亚结构域，共同组成 ＮＡＣ１ 结构域。Ｃ 端含有多个保守 的氨基酸，具有转录激活功能。同时蛋白中含有多个丝氨酸（Ｓ）、苏氨酸（Ｔ）和酪氨酸（Ｙ）磷酸化位点。８个ＮＡＣ１ 蛋 白都为亲水性蛋白，大多定位于细胞核，个别定位于细胞质或叶绿体。二级结构则以 螺旋和 折叠为主。８个 α β ＮＡＣ１ 蛋白三维结构上的相似性暗示了功能上存在相似。本研究结果为进一步挖掘生物逆境相关ＮＡＣ１ 转录因子的 功能和改良植物抗生物逆境特性提供理论依据。 关键词：生物胁迫；ＮＡＣ１ 转录因子；生物信息学；抗生物逆境特性 中图分类号：Ｑ７８ 文献标志码：Ａ 文章编号：１００２ １３０２（２０１６）１０ ００４３ ０６ ＮＡＣ（ＮＡＭ／ＡＴＡＦ／ＣＵＣ）转录因子家族是目前发现的最 侵，在拟南芥中过量表达 ＶｖＮＡＣ１ 基因可以增强植物对坏死 大的一类植物特有的转录因子，在其他真核生物中尚未发现 型和活体营养型病原菌的入侵，并且防御相关的植物激素 该家族成员［１ ２］。ＮＡＣ家族的命名源于矮牵牛（Ｐｅｔｕｎｉａｈｙｂｒ （如ＳＡ、ＭｅＪＡ、ＡＢＡ和乙烯）可以诱导葡萄 ＶｖＮＡＣ１ 基因的表 ｉｄａ）ＮＡＭ（ｎｏａｐｉｃａｌｍｅｒｉｓｔｅｍ）和拟南芥（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓｔｈａｌｉａｎａ） 达［２１］。在大麦中过量表达ＨｖＳＮＡＣ１ 基因能够增强大麦对镰 ＡＴＡＦ１、ＡＴＡＦ２ 以及ＣＵＣ２（ｃｕｐ ｓｈａｐｅｄｃｏｔｙｌｅｄｏｎ）基因［３ ４］。 刀菌的抗性，减轻叶斑病症状［２２］。一些研究表明，ＮＡＣ转录 研究表明，ＮＡＣ转录因子具有多种功能，在植物的生长发育、 因子在应答病毒入侵时也起着一定的作用。番茄曲叶病毒 器官建成、激素信号应答及逆境胁迫中均发挥重要的作用，已 （ｔｏｍａｔｏｌｅａｆｃｕｒｌｖｉｒｕｓ，ＴＬＣＶ）能够诱导番茄ＳｌＮＡＣ１ 基因的表 成为当前植物基因功能及表达网络调控研究中的热点［２，５ ６］， 达，并且该病毒编码的 Ｒｅｎ（ｇｅｍｉｎｉｖｉｒａｌｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎｅｎｈａｎｃｅｒ） 如枝顶端分生组织发育［７］ ［８ １０］ ［１１］ 蛋白能与ＳｌＮＡＣ１ 蛋白相互作用，过量表达ＳｌＮＡＣ１ 后可以加 、植物的衰老 、细胞分裂 、植 物激素调控与信号转导［１２ １３］和参与生物胁迫中植物的防御 速ＴＬＣＶ 的ＤＮＡ积累［２３］。 反应［１４ １６］等。 因此本研究将通过生物信息学的方法对生物逆境胁迫相 ＮＡＣ转录因子是一个庞大的家族，大量的 ＮＡＣ 基因被 关的普通烟 ＮｔＮＡＣ１、番茄 ＳｌＮＡＣ１、拟南芥ＡｔＡＴＡＦ１、辣椒 识别，其中在拟南芥中已发现 １１７ 个 ＮＡＣ基因，水稻中发现 ＣａＮＡＣ１、大麦ＨｖＳＮＡＣ１、小麦ＴａＮＡＣ１、水稻ＯｓＮＡＣ１ 和葡萄 １５１ 个ＮＡＣ基因，葡萄中发现７９ 个 ＮＡＣ 基因，烟草中发现