血红蛋白表征的in silico分析引领糖基化敏感性研究迈向新领域-排版.pdf

算分子生物学(网络版), 2015 年, 第 4 卷, No.7, 1-13 Jisuan Fenzi Shengwuxue (Online), 2015, Vol.4, No.7, 1-13 究报告 Research Report 血红蛋白表征的In silico分析引领糖基化敏感性研究迈向新领域 Reza , Ahmad , Fazlolah , Seyed 1 动物遗传学系, 农学部, Bu-Ali Sina University, 哈马丹, 伊朗 2 动物遗传学系, 伊朗农业生物技术研究所, 雷什特, 伊朗 3 动物遗传学系, 农学部, University of Guilan, 雷什特, 伊朗 通讯作者, Talebi_re@; 作者 计算分子生物学, 2015 年, 第 4 卷, 第 7 篇 doi: 10.5376/.2015.04.0007 收稿日期: 2015 年09 月07 日 接受日期: 20 15 年09 月07 日 发表日期: 2015 年09 月07 日 2015 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台 本文首次以英文发表在 Computational Molecular Biology 2015, Vol. 5, No. 1, 1-13 上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用Creative Common s Attribution License 协议对其进行授权，用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如 果读者对中文含义理解有歧义，请以英文原文为准。 摘 要 应用In silico 分析不同物种的血红蛋白表征特别是糖基化的抗性。多重序列比对结 显示骆驼、人类、牛和马中都 具有L-K-V-K-E-G-E-A-L-R-P-T-F-F-D-L-S-A-V-K-H-G-K-V-H-D-L-S-L-H-K-L-V-D-P-N-F-L-L-L-A-F-T-P-A-K-V-L-Y 的2 个 血红蛋白亚基序列。血红蛋白序列在进化过程中和不同物种之间是非常保守的。双峰驼家庭 HBA 存在于相同的群体(91% bootstrapping) ，然而 HBB 在同一个群体(95% bootstrapping) 。骆驼血红蛋白似乎比其他物种更加基础。基于等电点，骆驼 HBB 在电泳中具有高于HBA 的迁移率。骆驼中血红蛋白的带电荷和亲水性氨基酸比人类多。葡萄糖与蛋白质或HbA1c 的 非酶结合被揭示，人类中的两个亚基血红蛋白都具有对N-糖基化的抗性，但骆驼HBB 仅对O-糖基化具有抗性。此 ，HBB 在骆驼中具有关键作用，例如对糖基化和之后糖尿病的抗性。 关键词 In silico；多重比对；血红蛋白；糖基化；HbA1c In Silico investigation for hemoglobin characterizations leads to new aspects in susceptibility to glycosylation Reza Talebi 1 , Ahmad Ahmadi 1 , Fazlolah Afraz 2 , Seyed Zeyaedin Mirhoseini 3 1. Department of Animal Genetics, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran 2. Department of Animal Genetics, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Rasht, Iran 3. Department of Animal Genetics, Faculty of Agriculture, University of Guilan, Rasht, Iran Corresponding author, Talebi_re@; Author