厌氧铵氧化过程中关键酶及相关分子标记在生态学研究中的 - 生态学报.pdf

第 ３６ 卷第 １３期 生 态 学 报 Ｖｏｌ．３６，Ｎｏ．１３ ２０１６年７月 ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ｊｕｌ．，２０１６ ＤＯＩ：１０．５８４６／ ｓｔｘｂ２０１４１１０７２２０９ 白刃，贺纪正，沈菊培，陈新，张丽梅．厌氧铵氧化过程中关键酶及相关分子标记在生态学研究中的应用进展．生态学报，２０１６，３６（１３）：３８７１⁃３８８１． ＢａｉＲ，ＨｅＪＺ，ＳｈｅｎＪＰ，ＣｈｅｎＸ，ＺｈａｎｇＬＭ．Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆｔｈｅｋｅｙｅｎｚｙｍｅｓｉｎｔｈｅａｎａｍｍｏｘｐｒｏｃｅｓｓａｎｄｅｃｏｌｏｇｉｃａｌｉｎｆｅｒｅｎｃｅｓｄｅｒｉｖｅｄｆｒｏｍｒｅｌａｔｅｄｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ．Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０１６，３６（１３）：３８７１⁃３８８１． 厌氧铵氧化过程中关键酶及相关分子标记在生态学研 究中的应用进展 １，３ １ １ ２ １，∗ 白　 刃 ，贺纪正 ，沈菊培 ，陈　 新 ，张丽梅 １ 中国科学院生态环境研究中心，城市与区域生态国家重点实验室，北京　 １０００８５ ２ 中国科学院大气物理研究所，大气边界层物理和大气化学国家重点实验室，北京　 １０００２９ ３ 中国科学院大学，北京　 １０００４９ 摘要：厌氧铵氧化是由微生物介导的氮素循环过程中的重要途径之一。 近２０年来，通过对厌氧铵氧化细菌生态学、基因组学和 生理代谢特性的探索，人们对其微生物学机制已经有了较多的认识：厌氧铵氧化细菌通过亚硝酸盐还原酶将亚硝酸根离子还原 为一氧化氮，进而与铵离子结合在联氨合成酶的作用下生成联氨，最后通过联氨氧化酶的催化产生终产物氮气。 同时，对参与 这些过程的关键酶及其功能基因的认识有助于选择新的分子标记，从而为研究厌氧铵氧化细菌的多样性和分子生态学特征提 供新的工具，以弥补１６ＳｒＲＮＡ基因特异性相对较低且难以与生态功能关联等方面的不足。 对目前已知的参与厌氧铵氧化过程 的３种关键酶的研究历程和现状进行了评述，并总结了利用３种功能基因进行厌氧铵氧化细菌生态学研究的最新进展。 关键词：厌氧铵氧化作用；氮循环；酶；多样性 Ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ ｔｈｅ ｋｅｙ ｅｎｚｙｍｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ａｎａｍｍｏｘ ｐｒｏｃｅｓｓ ａｎｄ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅｓ ｄｅｒｉｖｅｄ ｆｒｏｍ ｒｅｌａｔｅｄ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ １，３ １ １ ２ １，∗ ＢＡＩ Ｒｅｎ ，ＨＥ Ｊｉｚｈｅｎｇ ，ＳＨＥＮＪｕｐｅｉ ，ＣＨＥＮ Ｘｉｎ ，ＺＨＡＮＧ Ｌｉｍｅｉ １ＳｔａｔｅＫｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｕｒｂａｎ ａｎｄ Ｒｅｇｉｏｎａｌ Ｅｃｏｌｏｇｙ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８５，Ｃｈｉｎａ ２ＳｔａｔｅＫｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｔｙ ｏｆ Ａｔｏｍｏｓｐｈｅｒｉｃ Ｂｏｕｎｄａｒｙ Ｌａｙｅｒ Ｐｈｙｓｉｃｓ ａｎｄＡｔｍｏｓｐｈｅｒｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ａｔｏｍｓｐｈｅｒｉｃ Ｐｈｙｓｉｃｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００２９，Ｃｈｉｎａ ３ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００４９，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｎａｍｍｏｘ （ａｎａｅｒｏｂｉｃ ａｍｍｏｎｉｕｍ ｏｘｉｄａｔｉｏｎ） ｉｓ ａ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ⁃ｍｅｄｉａｔｅｄ ｐａｔｈｗａｙ ｔｈａｔ ｐｌａｙｓ ａｎ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｒｏｌｅ ｉｎ ｎｉｔｒｏｇｅｎ ｃｙｃｌｉｎｇ．Ｏｖｅｒｔｈｅｐａｓｔｔｗｅｎｔｙｙｅａｒｓ，ｔｈｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｔｈｅａｎａｍｍｏｘｐｒｏｃｅｓｓａｎｄｍｉｃｒｏｂｉａｌｍｅｔａｂｏｌｉｓｍｈａｖｅｂｅｅｎ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｂｙ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ，ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌ，ａｎｄ ｇｅｎｏｍｉｃ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎｓ． Ａｎａｍｍ