台湾酵母菌多样性调查.pdf

第七屆海峽兩岸真菌學學術研討會論文集 63–78 臺灣酵母菌多樣性調查 汪碧涵 王嬿婷 東海大學生命科學系 摘 要 本研究調查臺灣水域及原生植物葉表的酵母菌多樣性。由臺灣本島及離島沿岸 75 個採樣點的海水、 二仁溪四個採樣點的河水、福山植物園和南仁山保護區永久大型樣區中 45 種植物葉表分離酵母菌， 共分得 988 株海洋酵母菌，82 株河水酵母菌及 103 株植物葉表酵母菌。酵母菌的鑑定主要以形態特徵 和生理生化特性為主，核醣體 DNA ITS 片段的 PCR-RFLP 圖譜為輔。結果發現，臺灣海水中五種分 佈較普遍的紅色酵母菌為 Rhodotorula graminis 、R. marina 、R. minuta 、R. mucilaginosa 與 R. slooffiae ，其中R. graminis 、R. marina 與 R. slooffiae 為臺灣新紀錄種，且僅需以 HinfI 與 CfoI 二種酵 素的 RFLP 指紋即可加以區分。二仁溪的酵母菌主要菌屬為 Candida 及 Pichia 二屬，大部分的菌株亦 可 HhaI 、HinfI 與 HaeIII 三種酵素的 RFLP 指紋區分。上述方法無法鑑定者，再輔以核醣體 DNA LSU 的 D1/D2 序列和 ITS 序列資料，與 GenBank 中已知序列進行比較分析，將可完成鑑定或分析其 親緣關係。原生植物葉表菌株則以 Cryptococcus 屬菌株最多，分佈在最多種植物上。 關鍵詞：核醣體 DNA 、Candida 、Cryptococcus 、PCR-RFLP 、Rhodotorula 。 前 言 食品中分離得到，由土壤及空氣中分離的菌 株則有 21 種 49 株，由其他自然資源獲得的 酵母菌及類酵母真菌不成為一個分類群， 酵母菌菌株則沒有任何紀錄。就種原保育的 它們多數行出芽生殖，少數行分裂生殖，有 觀點來看，水生環境與陸生環境中酵母菌生 些種形成菌絲或偽菌絲 (pseudomycelium) ， 物資源的調查、基本資料庫的建立以及菌種 它們包括子囊菌、擔子菌和不完全菌。現 保存都應該有系統地開展。 在，有記錄的酵母菌超過七百種，熟為人知 臺灣位於太平洋海盆西側，地屬亞熱帶與 的菌種倒是寥寥可數，實際上，只有少數的 熱帶交界，四面環海，海岸線長達 1,141 公 酵母菌棲地被研究過，可能還有許多新種待 里。另外還包括有澎湖群島、小琉球、蘭 發現。 嶼、綠島、龜山島等 70 餘個小島，形成一 臺灣酵母菌的研究報告，多侷限於臨床、 個具有廣闊沿岸及近海之海域。而且臺灣由 食品微生物及植物病理學的範疇，自然環境 於位於地殼活躍地區，伴隨地殼運動而隆起 中的酵母菌的系統性的調查研究，僅宋世謹 的岩層，在極小的面積中拔升近 4,000 公 (Sung, 1966) 、鄭玉珍和林良平 (1977) 、謝文 尺，因此形成臺灣河床異常陡峻且水急路短 陽等人 (Shieh et al., 1996) 的報告而已。在食 的特徵。 品工業發展研究所生物資源保存及研究中心 酵母菌是海水與淡水中廣泛分布的微生物 所保存的酵母菌菌株中，由臺灣所分離的菌 族群，其密度隨著水體的污染程度而增加 株有 33 種 102 株 (2000) ，其中大多數是由 (Hagler and A