生物信息学教学资料:分子进化分析.pptVIP

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  • 2017-07-12 发布于浙江
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生物信息学教学资料:分子进化分析.ppt

Plant Transcription Factor Database / http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/ /AnimalTFDB/ Animal Transcription Factor Database / CATH : a classification of protein structures downloaded from the Protein Data Bank / Pfam : a large collection of protein families * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 原始数据多 序列比对结果 对序列中每个 位置重复抽样, 基于原比对结果 生成多个样本 Original tree Bootstrap consensus tree 节点上的值为通过 Bootstrap检验次数的百分数 实例一:WRKY基因家族的进化分析 Phylogenetic analyses of WRKY gene family 1. WRKY是什么? 主要存在于植物中的一类新的转录因子 保守区为约60个氨基酸的WRKY结构域 是一类DNA结合蛋白 与W-box(T)(T) TGAC (C/T)特异性结合 含

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