生物信息学教学资料:生物信息学常用数据库.pptVIP

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  • 2017-07-12 发布于浙江
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生物信息学教学资料:生物信息学常用数据库.ppt

* * * * * PSI-BLAST 可以幫使用者比對相同蛋白質家族的氨基酸序列 PHI-BLAST 可以就特定的氨基酸部分進行比對; * PAM模型可用于寻找蛋白质的进化起源,而BLOSUM模型则用于发现蛋白质的保守域。 * Pam 1 表示有1%的氨基酸形成突变 Blosum62 表示比对结果中至少有62%的氨基酸相同 * * * * * * * * * * * * * /proteomics * /uniprot/?query=hbsagsort=score * PIR (Protein Information Resource) 国际蛋白质序列数据库,包含所有序列已知的自然界中野生型蛋白质信息。提供同源性和分类学组织的综合、非冗余的数据库。每周更新,每季度发行新版。 / /pir_databases/ UniProt SWISS-PROT+TrEMBL+PIR / ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/uniprot/ * PIR(protein information resource) 1. 由美国NCBI翻译自GenBank的DNA序列(1984年); 2. 在EMBL和GenBank数据库上均建立了镜像站点; 3. 数据依据注释的质量分为4类。 网址: / 分类名称 (Name) 说明 (C

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