生物信息学教学资料:序列比对—第二次作业.pptVIP

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  • 2017-07-12 发布于浙江
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生物信息学教学资料:序列比对—第二次作业.ppt

谢谢观赏 1.要对所分析的多序列目标进行排列(To align sequences)。做ALIGNMENT的软件很多,最经常使用的有CLUSTALX和CLUSTALW,前者是在WINDOW下的而后者是在DOS下的。 * “ ” 多序列比对与Clustal的使用及PHYLIP软件构建系统发生树 中南大学生命科学学院 2015年5月4日 生命科学1201班 马子良 周宇筝 进化树(Phylogenetic tree)分析 1 2 3 一、序列相似性比较和序列同源性分析 多序列比对的意义 多序列比对的方法 多序列比对的方法 自动多序列比对的算法 自动多序列比对的算法 多序列比对工具 -clustal Clustal的渐进比对过程 Clustal的工作原理 Clustalx的工作界面 (多序列比对模式) 第一步:输入序列文件 第二步:设定比对的一些参数 参数设定窗口 第三步:开始序列比对 第四步:比对完成,选择保存结果文件的格式 Clustal的应用 “ ” 1.要对所分析的多序列目标进行排列(To align sequences)。做ALIGNMENT的软件很多,最经常使用的有CLUSTALX和CLUSTALW,前者是在WINDOW下的而后者是在DOS下的。 *

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