植物功能基因组学研究进展.pdfVIP

玉 米 科 学2008。16(2)：56—59 Joumal of Maize Sciences 文章编号：1005—0906(2008)02—0056—04 植物功能基因组学研究进展 常敬礼，郭玉双，杨德光，李丽文 (东北农业大学农学院，哈尔滨 150030) 摘 要：对植物功能基因组学的研究方法进行了论述，包括微阵列或DNA芯片、EST技术、SAGE技术、蛋白质 组学技术、反向遗传技术及生物信息学技术等，对植物功能基因组学研究中可能遇到的问题进行了分析。 关键词：植物；功能基因组学；DNA芯片；反向遗传学；生物信息学 中图分类号：$513 文献标识码：A The Research of Overview in Plant for FunctionaI Genomics Techniques CHANG Jing-li，GUO Yu-shuang，YANG De-guang，LI Li-wen (College ofAgricultural,Northeast Agricultural University,Harbin 150030，China) Abstract：Nowadays，the research on functional genomics in plant is the hot point of investigation in botany．In this paper，we summarized the research methods of functional genomics in plant，including the microarray technology， DNA chip，EST technology，SAGE technology，proteomics，reverse genetics，and bioinformatics，etc．Furthermore，we analyzed the problems we may meet in the study of plant functional genomics． Key words：Plant；Functional genomics；DNA chip；Reverse genetics；Bioinformatics 基因组学是20世纪90年代兴起的最活跃的研 1．1 微阵列或DNA芯片 究领域之一。功能基因组学(Functional genomics)的 微阵列(microarrays)技术又称为微排列或微点 研究又被称为后基因组学(Post genomics)研究，它是 阵，是一种新的、能够全面和系统地研究基因组功能 利用结构基因组学提供的信息和产物，通过在基因 的有利手段，能高效率、大规模地获取相关生物信 组或系统水平上全面分析基因的功能，使得生物学 息。根据微阵列上遗传信息的载体不同，可分为DNA 研究从对单一基因或蛋白质的研究转向对多个基因 微阵列(DNA microarrays)、cDNA微阵~(cDNA micloar— 或蛋白质同时进行系统研究。功能基因组学的研究 rays)。cDNA微阵列的和DNA微阵列的原理基本相 内容主要包括基因功能发现、基因表达分析及其突 同，即利用核酸杂交原理检测基因表达过程中产生 变检测等。它主要采用比较基因序列和测定基因组 的cDNA分子它是由核酸片段如一系列用特定荧光 序列两大类方法，从基因组整体水平上对基因的活 标记的寡核苷酸探针，以预先设计排列方式固定在 动规律进行阐述。 载玻片或尼龙膜上组成生物集成膜片，与不同标记 植物功能基因组学是植物后基因时代研究的核 的游离cDNA分子杂交，或生物集成膜片上的cDNA 心内容，它强调