质谱技术在蛋白质组学研究中的应用 - 南京林业大学学报.pdf

第３５卷　第１期 南京林业大学学报（自然科学版） Ｖｏｌ．３５，Ｎｏ．１ ２０１１年１月 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＮａｎｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ） Ｊａｎ．，２０１１ ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｌｄｘｂ．ｃｏｍ［ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１０００－２００６．２０１１．０１．０２４］ 质谱技术在蛋白质组学研究中的应用 甄　艳，施季森 （南京林业大学，林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室，江苏　南京　２１００３７） 摘要：随着蛋白质组学研究的迅速发展，质谱技术已成为应用于蛋白质组学研究中的强有力工具 和核心技术。质谱技术的先进性在于为蛋白质组学研究提供的通量和分子信息。笔者重点概述 了基于质谱路线的蛋白质组学研究，介绍了基于质谱的定量蛋白质组学 翻译后修饰蛋白质组 学、定向蛋白质组学、功能蛋白质组学以及基于串联质谱技术的蛋白质组学数据解析的研究 进展。 关键词：质谱；蛋白质组学；定量蛋白质组学；翻译后修饰；定向蛋白质组学；功能蛋白质组学 中图分类号：Ｑ８１　　　　文献标志码：Ａ　　　　文章编号：１０００－２００６（２０１１）０１－０１０３－０６ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｉｎｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓｓｔｕｄｉｅｓ  ＺＨＥＮＹａｎ，ＳＨＩＪｉｓｅｎ （ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＦｏｒｅｓｔＧｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎ， ＮａｎｊｉｎｇＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ２１００３７，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｗｉｔｈｔｈｅｒａｐｉｄｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ，ｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｉｓｍａｔｕｒｉｎｇｔｏｂｅａｐｏｗｅｒｆｕｌｔｏｏｌａｎｄｃｏｒｅｔｅｃｈ ｎｏｌｏｇｙｆｏｒｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓｓｔｕｄｉｅｓｄｕｒｉｎｇｔｈｅｒｅｃｅｎｔｙｅａｒｓ．Ｔｈｅｓｕｐｅｒｉｏｒｉｔｙｏｆｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｌｉｅｓｉｎｐｒｏｖｉｄｉｎｇｔｈｅｔｈｒｏｕｇｈ ｐｕｔａｎｄｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ，ｗｈｉｃｈｎｏｏｔｈｅｒｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｃａｎｂｅｍａｔｃｈｅｄｉｎｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ．Ｉｎｔｈｉｓｒｅｖｉｅｗ，ｗｅｍａｄｅａ ｇｌａｎｃｅｏｎｔｈｅｏｕｔｌｉｎｅｏｆｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｂａｓｅｄｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ．Ａｎｄｔｈｅｎｗｅａｄｄｒｅｓｓｅｄｏｎｔｈｅａｄｖａｎｃｅｓｏｆｄａｔａａｎａｌｙｓｉｓｏｆ ｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｂａｓｅｄｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ，ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙｂａｓｅｄｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ，ｐｏｓｔｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｂａｓｅｄｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ｔａｒｇｅｔｅｄｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓａｎｄｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓｂａｓｅｄｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ；ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ；ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ；ｐｏｓｔｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ；ｔａｒｇｅｔｅｄｐｒｏ ｔｅｏｍｉｃｓ；ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ 　　蛋白质组学（Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ）是从整体水平上研究 ｔｒａｐ，ＩＴ），飞行时间（ｔｉｍｅｏｆｆｌｉｇｈｔ，ＴＯＦ），串联飞行 细胞内蛋白质的组成、活动规律及蛋白质与蛋白质 时间（ＴＯＦＴＯＦ），四级杆／飞行时间（ｑｕａｄｒｕｐｏｌｅ／ 的相互作