美国生物信息学领域若干科研项目计划.pdf

资讯观察 NEWS VIEWS 美国生物信息学领域若干科研项目计划 Several Research Programs of Bioinformatics in USA 功，本项目旨在发展新的计算方法，以生成可用实验 美国国立卫生研究院（NIH） 验证的原子水平的GPCR模型。本项目重点将放在五个 资助的部分项目： 重要的药物家族上，包括肾上腺素、趋化因子、多巴 胺、组胺和毒蕈碱型乙酰胆碱。具体目标是：（1） 1）项目名称：蛋白质对接算法开发（Continual 为原子级GPCR蛋白质结构建模开发和测试一个新的 Development of Protein Docking Algorithms） GPCR-TASSER算法。（2）开发和优化GPCR简化的原子 项目负责人：Weng, Zhiping（副教授） 组成。（3）发布GPCR-TASSER算法以供公众使用。 项目承担单位：马萨诸塞大学医学院 （4）在药物学的重要GPCRS中应用GPCR-TASSER算 起始日期：2009年5月1日 法。（5）同实验合作者共同验证和完善GPCR模型 。 完成日期：2013年4月30日 长期目标是：（a）为自动和原子级的GPCR结构预测 在2009财年拨款的项目经费：311,442美元 制定一套计算机算法；（b）将方法扩展到对UniProt NIH研究所：NIGMS（美国国立综合医学科学研 数据库中所有的GPCRs进行蛋白质组学级别的结构建 究所） 模；(c) 为公开访问的GPCR算法和结构数据库建立一 摘要：本项目的目标是发展计算方法、算法和软 个中央资料库，其最终目的是为了缓解生物界和医学 件用于预测蛋白-蛋白复合物的三维结构。这种方法 界对GPCR详细原子结构的迫切需求。 可以帮助我们深入了解蛋白相互作用的生物机能，并 且可以指导我们设计新的药物。 3) 项目名称：应用统计方法对公共芯片数据库 进行二次分析（Applied Statistics to a Secondary 2) 项目名称: 对G蛋白偶联受体在原子级的大规 Analysis of Public Repositories for Microarray） 模结构预测（Atomic-level, Large-scale Structure 项目负责人：Huang, Haiyan Prediction of G Protein-coupled Receptors） 项目承担单位：加州大学伯克利分校 项目负责人：Zhang, Yang 起始日期：2009年5月1日 项目承担单位：堪萨斯大学 完成日期：2011年4月30日 起始日期：2009年5月1日 在2009财年拨款的项目经费：228,949美元 完成日期：2013年2月28日 NIH研究所：NEI（美国国立眼科研究所） 在2009财年拨款的项目经费：305,578美元 摘要：全基因组基因表达分析越来越多的使用产 NIH研究所： NIGMS （美国国立综合医学科学 生了海量的宝贵数据，这些数据为进一步讨论最初没 研究所）