原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
中药植物虎杖根的高通量转录组测序及转录组特性分析
中国科学: 生命科学 2012 年 第42 卷 第5 期: 398 ~ 412
《中国科学》杂志社
SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS
论 文
中药植物虎杖根的高通量转录组测序及转录组
特性分析
①* ② ① ②* ②* ② ③ ② ②
郝大程 , 马培 , 穆军 , 陈士林 , 肖培根 , 彭勇 , 霍利 , 许利嘉 , 孙超
① 大连交通大学环境学院生物技术研究所, 大连 116028;
② 中国医学科学院药用植物研究所, 中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室, 北京 100193;
③ 大连交通大学软件学院, 大连 116028
* 联系人, E-mail: hao@; slchen@; xiaopg@
收稿日期: 2012-01-23; 接受日期: 2012-04-09
国家科技重大专项(批准号: 2008ZX10005-004)资助
摘要 中药植物虎杖已有上千年的应用历史, 从虎杖根部已提取出多种药用活性成分. 但 关键词
目前尚不清楚虎杖次级代谢过程中这些活性物质合成的遗传基础. 采用 Illumina HiSeq 2000 虎杖
根
高通量测序获得虎杖根转录组的 条短读序(2.3 Gb), 用生物信息学方法从头组装并
转录组
注释了86418 个Unigene(单基因簇). 研究发现, 虎杖根部表达的 12, 18, 60 和54 个Unigene
高通量测序
分属于甲羟戊酸(MVA)、2- 甲基-D-赤藓糖醇4-磷酸(MEP)、莽草酸和白藜芦醇生物合成路径, 次级代谢
它们可能参与药用活性物质蒽醌类和白藜芦醇的生物合成. 实验发现, 18 个尿苷二磷酸-葡萄 重复序列
糖基转移酶 Unigene 可能与糖苷类次级代谢物生物合成有关. 识别次级代谢物生物合成相关 直系同源基因
基因可为未来通过基因工程操纵提高有用成分的含量奠定基础. 本研究基于19 种非模式植物
的高通量转录组数据识别出1127 个共有的直系同源基因, 将用于植物功能、系统发育和进化
等研究.
Polygonum cuspidatum , 又称虎杖, Japanese 作为中药使用已有上千年的历史, 常用于止痛、退
knotweed 或墨西哥竹(Mexican bamboo), 属双子叶蓼 热、利尿, 也用于治疗咳嗽、关节痛、慢性支气管炎、
科, 是一种大型多年生草本植物, 原产于东亚的中 黄疸、闭经和高血压等[2]. 分析表明, 虎杖根中含有
国、日本和朝鲜. 在北美和欧洲一些国家, 由于该物种 大量具有治疗效用的次级代谢物, 如白藜芦醇
地下根系发达, 生长旺盛, 已被列为外来入侵物种[1]. (resveratrol)、蒽醌类(anthraquinone)及其糖苷[3]. 白藜
蓼科药用植物很多, 如掌叶大黄(Rheum palmatum)、大 芦醇是一种多酚苯乙烯, 具有抗炎、抗癌、抗HIV[4] 、
黄(Rheum officinale) 、酸模(Rumex a
文档评论（0）