森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析 - 南京农业大学学报.pdf

－ 　 南京农业大学学报　 ２０１７ꎬ４０(２):２２５ ２３３ ｈｔｔｐ:/ / ｎａｕｘｂ.ｎｊａｕ.ｅｄｕ.ｃｎ 　 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＮａｎｊｉｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ＤＯＩ:１０.７６８５/ ｊｎａｕ.２０１６０７０１８ － 林莹ꎬ韩玉辉ꎬ熊思嘉ꎬ等. 森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析[Ｊ]. 南京农业大学学报ꎬ２０１７ꎬ４０(２):２２５ ２３３. 森林草莓组蛋白去乙酰化酶基因的鉴定和分析 林莹ꎬ韩玉辉ꎬ熊思嘉ꎬ李泽斌ꎬ张欣ꎬ顾婷婷∗ (南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/ 园艺学院ꎬ江苏 南京 ２１００９５) 摘要:[目的]本研究对森林草莓中组蛋白去乙酰化酶基因(ＨＤＡＣ)进行鉴定和分析ꎬ并研究其在生长发育以及逆境胁迫响 应过程中的表达变化ꎬ为深入研究森林草莓组蛋白去乙酰化调控机制奠定基础ꎮ [方法]运用生物信息学方法ꎬ对森林草莓 中ＨＤＡＣ基因进行鉴定ꎬ并进行蛋白结构域、染色体定位、基因复制类型和其他进化分析ꎮ 利用转录组数据分析森林草莓 中ＨＤＡＣ基因在不同组织和发育阶段中的表达变化ꎮ 运用实时荧光定量ＰＣＲ对森林草莓中ＨＤＡＣ基因在低温、高温胁迫 下的表达变化进行分析ꎮ [结果]森林草莓中包含 １２个ＨＤＡＣ基因ꎬ其中ＲＰＤ３/ ＨＤＡ１家族９个ꎬＳＩＲ２家族２个ꎬＨＤ２家族 １个ꎻＲＰＤ３/ ＨＤＡ１家族基因可以分为５类ꎬＳＩＲ２家族中基因分为２类ꎮ 森林草莓中ＲＰＤ３/ ＨＤＡ１和ＨＤ２家族ＨＤＡＣ基因 主要通过离散型复制模式进行扩张ꎬＳＩＲ２家族在双子叶进化过程中没有发生明显扩张ꎮ 各个ＨＤＡＣ基因具有发育阶段或 组织特异性表达ꎮ 部分ＨＤＡＣ基因在森林草莓热胁迫处理中有不同程度的响应ꎬ对冷胁迫的反应相对较小ꎮ [结论]森林 草莓ＨＤＡＣ基因具有植物的典型特性ꎬ并可能参与了森林草莓的生长发育和对热胁迫的响应ꎮ 关键词:森林草莓ꎻ去乙酰化ꎻ进化分析ꎻ表达分析ꎻ基因复制ꎻ逆境胁迫 － － － 中图分类号:Ｓ６６８.４　 　 　 　 文献标志码:Ａ　 　 　 　 文章编号:１０００ ２０３０(２０１７)０２ ０２２５ ０９ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｈｉｓｔｏｎｅ ｄｅａｃｅｔｙｌａｓｅｓ ｉｎ Ｆｒａｇａｒｉａ ｖｅｓｃａ ＬＩＮ ＹｉｎｇꎬＨＡＮ ＹｕｈｕｉꎬＸＩＯＮＧ ＳｉｊｉａꎬＬＩ ＺｅｂｉｎꎬＺＨＡＮＧ ＸｉｎꎬＧＵ Ｔｉｎｇｔｉｎｇ∗ (Ｓｔａｔｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｃｒｏｐ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｇｅｒｍｐｌａｓｍ Ｅｎｈａｎｃｅｍｅｎｔ/ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅꎬ Ｎａｎｊｉｎｇ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＮａｎｊｉｎｇ ２１００９５ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:[Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅｓ]Ｔｈｉｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｉｍｓ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｔｈｅ ｈｉｓｔｏｎｅ ｄｅａｃｅｔｙｌａｓｅ(ＨＤＡＣ)ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｆｒａｇａｒｉａ ｖｅｓｃａꎬａｎｄ ｅｘｐｌｏｒｅ ｔｈｅｉｒ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ. Ｗｅ ａｌｓｏ ａｎａｌｙｚｅｄ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓｏｆＨＤＡＣｇｅｎｅｓｄｕｒｉｎｇ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｉｎｒｅｓ