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芽孢杆菌多相分类及应用研究进展 - yzxzcom
芽孢杆菌多相分类及应用研究进展
刘国红1,林乃铨2,高云超1,林营志1,刘波1*
(1福建省农业科学院生物技术研究所 福州 350003;2福建农林大学生防所 福州 350002)
摘 要:芽孢杆菌属的分类研究最初是根据形态学特征﹑培养特征及生理生化特征等表观分类学指证。随着多相分类方法的广泛应用,化学分类和分子分类在芽孢杆菌属的分类学研究中起到越来越重要的作用。不少芽孢杆菌应用到工业农业医学上,对人类社会做出了巨大贡献。
关键词:芽孢杆菌;多相分类;应用
中图分类号: 文献标识码: 文章编号:
早在1835年,Ehrenberg就发现并命名了枯草芽孢杆菌Vibrio. subtilis。1872年,德国植物学家Cohn建立了第一个细菌分类系统,根据细菌的形态特征命名了芽孢杆菌属(Bacillus),并将枯草芽孢杆菌重命名为Bacillus. subtilis。起初芽孢杆菌属的种类很少,随着技术研究方法的改进发展,越来越多的种被发现,尤其是70年代的分子分类法和80年代的化学分类法的应用,种的数量增多,分类地位确定的也越来越准确。根据2004年出版的《伯杰氏细菌鉴定手册》,芽孢杆菌属有85个种。从2004年至今发现的新种有49个,见表1。芽孢杆菌工业、农业、医学方面有重要的作用。
现在微生物分类领域比较著名的分类系统《伯杰氏细菌鉴定手册》(Bergey’s Manual of Determinative bacteriology)不同版本中关于芽孢杆菌属的描述来看本属分类系统的发展。
第一版 1923年出版。75种菌,芽孢杆菌属的描述:好氧,大多数腐生,通常能液化明胶,常链状或假根状,在产生孢子时菌体不发生大变化。
第二版 1925年出版。75种菌,芽孢杆菌属的描述:好氧,大多数腐生,通常能液化明胶,常链状或假根状,在产生孢子时菌体不发生大变化。
第三版 1930年出版。93种菌,芽孢杆菌属的描述:好氧,大多数腐生,通常能液化明胶,常链状或假根状,在产生孢子时菌体不发生大变化。
第四版:1934年出版。93种菌,芽孢杆菌属的描述:好氧,大多数腐生,通常能液化明胶,常链状或假根状,在产生孢子时菌体不发生大变化。
第五版:1939年出版。146种菌,芽孢杆菌属的描述:杆状细胞,有时成链。好氧,不运动或靠周生鞭毛游动。内生孢子,通常革兰氏反应阳性,化能异养型。
第六版:1948年出版。33种菌,芽孢杆菌属的描述:好氧,过氧化氢酶阳性。杆状,有时成链。孢囊类似营养细胞。有时为粗糙菌落,并在肉汤中形成菌膜。
第七版:1957年出版。25种菌,芽孢杆菌属的描述:细胞杆状,有时成链。能产生内生孢子。革兰氏阳性或染色不定。有时为粗糙菌落,并在肉汤中形成菌膜。
第八版:1974年出版。22种菌,芽孢杆菌属的描述:细胞为直的杆状,大小为0.3~2.2×1.2~7.0μm。大多数能够运动,鞭毛周生,能形成抗热芽孢,孢囊中仅有一个孢子,暴露于空气中不会阻碍孢子的形成。革兰氏阳性或仅在生命早期革兰氏阳性。化能异养,能利用各种基质。氧花型或发酵型代谢,氧化型代谢的末端电子受体是分子氧,有的种以NO3-代替作为电子受体。大多数产过氧化氢酶。严格好氧或兼性厌氧。DNA的G+C%为32~62%。
传统的芽孢杆菌分类主要依据其形态学特征,现在则大多采用多相分类法,即将形态、生理生化、化学(脂肪酸分析)、分子(DNA碱基分析、DNA同源性分析,16SrRNA测序)等分类方法相结合,并根据所得数据进行聚类分析,得出的结果相对比较准确。
经典分类(形态特征)(classic taxonomy)
芽孢杆菌,菌体杆状,直或近直,0.3~2.2×2.1~7.0 (m;多数运动;鞭毛典型侧生;形成抗热内生孢子;严格好氧或兼性厌氧。
芽孢杆菌属的建立就是根据形态特征确立的,开始发现的种由于实验条件的限制都是仅以形态特征进行分类。Gibson和Gorden依据芽孢的形状(卵形或球形)以及它们在菌体或芽孢囊中的位置,提出芽孢形态群体概念,将芽孢杆菌分为三个类群。由于这个种的分离方法是以群体来划分的,它对分类鉴定是非常有用的。
群1 孢囊不显著膨大,芽孢椭圆或柱形,中生到端生,革兰氏阳性。
A. 生长在葡萄糖洋菜上的淡染细胞的原生质中有不着色的球状体
1. 严格好氧;不产生乙酰甲基甲醇 …..巨大芽孢杆菌(B.megaterium)
2. 兼性厌氧;产生乙酰甲基甲醇 ……蜡状芽孢杆菌(B.cereus)
B.生长在葡萄糖洋菜上的淡染细胞的原生质中没有不着色的球状体
1. 7%氯化钠中生长;石蕊牛奶不产酸
a.在pH5.7生长;产生乙酰甲基甲醇
(1)水解淀粉;硝酸盐还原到亚硝酸盐
(a)兼性
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