分子生物学 - 一般目录.docVIP

基础分子生物学1、绪论2、染色体与DNA 3、生物信息的传递（上）——从DNA到RNA4、生物信息的传递（下）——从mRNA到蛋白质5、基因的表达与调控（上）——原核6、基因的表达与调控（下）——真核染色体与DNA一、 DNA的组成与结构 二、 DNA的生理意义三、 C-Value和Cot1/2 四、 染色体结构五、 染色体的组成 六、 原核与真核染色体DNA比较第三章 DNA复制DNA代谢 DNA复制 哺乳动物DNA聚合酶 DNA连接酶 单链结合蛋白(SSB) 解链酶 拓扑异构酶Ⅰ 拓扑异构酶Ⅱ 引物酶 引发前体蛋白DNA复制的起始 2.DNA子链的延伸 3.DNA链的终止复制的方式线状DNA末端复制的问题 真核生物染色体端粒的复制突变和修复突变概述突变的定义突变的分类：染色体畸变、基因突变；多点突变、单点突变（碱基插入、缺失、替代）、碱基替代； 同义突变、错义突变、无义突变；正向突变、回复突变诱发突变和自发突变碱基类似物 二、DNA分子上碱基的化学修饰 三、嵌合剂的致突变作用四、转座成分的致突变作用 五、增变基因 六、紫外线和高能射线的致突变作用 七、突变热点DNA的修复复制修复：1.尿嘧啶－糖基酶系统 2.错配修复系统损伤修复光修复：（直接修复）：胸腺嘧啶二聚体 2.切除修复 3.重组修复 4.SOS response重组和转座重组的分类?同源重组或普遍性重组 2、位点特异性重组 3、转座模板选择（copy choice）性重组同源重组Holliday连接Rec BCD途径－同源重组的酶学机制：1.Overview 2.RecBCD: 3.Rec A 4.Ruv A-B-C基因转换(gene conversion)位点特异性重组位点特异性重组最典型的列子是λ噬菌体对E.coli的整合。att位点 2、整合和切离的相关蛋白 3、λ整合通常是通过单链交换而不是“一致性剪切”转座原核转座子的类型：1、插入序列 2、复合转座子 3、Tn A家族转座机制：1、复制型转座 2、非复制型转座 3、?保守转座转座中的一般过程非复制转座：转座子插入到DNA上新的位点，首先交错切开靶DNA，再将转座子连接到靶DNA的凸出单链上， 最后填补空缺完成转座非复制转座的断裂和再连接过程复制型转座真核生物的转座因子：Ac-Ds系统转录和转录后加工RNA聚合酶一、RNA合成的基本特征：-RNA的前体: ATP，GTP，CTP，UTP-RNA合成的方向: 5’ → 3’-RNA聚合酶能起始一条新链的合成，起始核苷酸一般是嘌呤核苷三磷酸（pppA或 pppG）-RNA聚合酶以单链为模板，一个NTP的3’-OH和另一个NTP的5’-P反应，去掉焦磷酸，形成磷酸酯键原核生物的RNA聚合酶RNA聚合酶的组成 2、σ亚基三、真核生物的RNA聚合酶第二节 启动子一、原核生物启动子：1、-10序列 2、-35序列 3、CAP位点 4、葡萄糖效应二、真核生物启动子和转录因子：真核生物启动子由转录因子而不是RNA聚合酶识别1.RNA聚合酶I启动子1) 核心启动子序列2) 上游启动子序列3) RNA聚合酶I需要两类转录因子参与作用2. RNA聚合酶III启动子 1) 5SrRNA和tRNA基因为内在启动子，位于转录单位内部 2) 核内小RNA(snRNA)基因的启动子位于转录起始位点上游(type 3) 3) RNA聚合酶III的转录因子3.RNA聚合酶II的启动子 1）核心启动子的成分：主要决定转录起始点的位置 2）上游启动子元件：控制转录起始频率 3) RNA聚合酶II的转录因子TBP是三种RNA聚合酶通用的转录因子 1) TBP与DNA小沟结合，形成一个马鞍形结构 2) TBP的结合使DNA弯曲约80°转录的起始、延伸和终止一、起始:1）起始识别：RNA聚合酶与启动子结合形成封闭的启动子复合物，识别位点在-35处；2）活化：-10区域形成形成开放的启动子复合物，解开双链；3）形成三元起