无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析 - 中国农学通报.pdfVIP

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2017-09-02 发布于天津
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无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析 - 中国农学通报.pdf

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无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析 - 中国农学通报

中国农学通报 2013,29(7): 111-116 Chinese Agricultural Science Bulletin 无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析 1 2 1 1 1 刘兴地，莫坤联，郑楷，郑学勤，李明芳 1 2 （中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海口571101；海南大学，海口571101）摘要：为获得在无核荔枝中胚珠退化过程中差异表达的生长素反应因子基因(ARF) ，对其全长的克隆并进行分析，根据构建的无核荔枝胚珠败育SSH 消减文库的生长素反应因子EST 序列，提取高质量的 RNA ，通过SMART-RACE 技术，获得一个生长素反应因子3501 bp 的核苷酸序列。应用生物信息学软件进行分析,预测该序列含有2550 bp 的开放阅读框，推导的蛋白质为849 个氨基酸，具有B3、Auxin_resp 和AUX_IAA 保守区与结构功能域。分析表明该基因为ARFs 基因家族中的一个新成员，进化树上与芒果亲缘关系最近。关键词：无核荔枝；ARF ；克隆；序列分析中图分类号：Q812 文献标志码：A 论文编号：2012-3086 Cloning and Sequence Analysis of Auxin Response Factor of Seedless Litchi 1 2 1 1 1 LiuXingdi,MoKunlian,ZhengKai,ZhengXueqin,LiMingfang 1 (InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology,CATAS,Haikou571101; 2HainanUniversity,Haikou571101) Abstract: To obtain the auxin response factor gene (ARF) that was differentially expressed in ovule degenerationofseedlesslitchi,inthisstudythegenewasclonedandanalyzed.TheESTencodingARFwas obtainedfromyoungabortiveovuleofseedlesslitchiviaSSH(suppressionsubtractivehybridization),extracted highqualityRNAandclonedthetotalcDNAsequencebySMAT-RACEmethod,bioinformaticsanalysis showedthatitincludedan 2550 bpopenreadingframewhichencodedapredicatedproteinwith 849 amino acids,moreover,ithadB3,Auxin_respandAUX_IAAconservedregionandfunctionaldomains,indicatedthat itwasanewmemberoftheARFsgenefamilyandgottheclosestrelativeswithMan