关于2第二章2 核酸化学.pptVIP

* 5’ 5’ 3’ 3’ * * 核苷酸的连接方式 DNA和RNA都是没有分支的多核苷酸长链，链中每个核苷酸的3’-羟基和相邻核苷酸的戊糖上的5’-磷酸相连。连接键： 3’，5’-磷酸二酯键 DNA和RNA都具有特殊的方向性 每条线形的核苷酸链都有一个3’ -末端和一个5’-末端。 * DNA RNA 5′PdAPdCPdGPdTOH 3′ 5′PAPCPGPUOH 3′ 或 5′PA-C-G-T 3′ 5′ PA-C-G-U 3′ PACGT PACGU T 5’ 3’ OH U 5’ 3’ OH OH OH OH OH 多聚核苷酸的表示方式 5′-磷酸端（常用5’-P表示）；3′-羟基端（常用3’-OH表示） 多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是5′→3′或是3′→5′。 * 核酸的一级结构：各核苷酸残基沿多核苷酸链排列的顺序（序列）。 碱基序列表示核酸的一级结构。　　　　 * 第三节 DNA的结构 一、 DNA的一级结构 二、 DNA的二级结构 三、 DNA的三级结构 四、 DNA和基因组 * DNA的碱基组成规律（Chargeff规则） A+G=T+C 1、DNA中，两类碱基的总和是相等的。即嘌呤碱和嘧啶碱的摩尔总数相等，且在以摩尔为单位的条件下， A=T，G=C * 2、 DNA的碱基组成具有种属的特异性。 3、 DNA的碱基组成没有组织和器官的特异性。 4、 DNA的碱基组成不受年龄、营养状况等的影响。 dAMP=dA, dGMP=dG, dCMP=dC, dTMP=dT 高级结构只有二级、三级。 * 一、DNA的一级结构 多核苷酸链中脱氧核甘酸的排列顺序 可以用碱基排列顺序表示 连接键：3’，5’-磷酸二酯键 磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架 碱基形成侧链 多核苷酸链均有5’-末端和3’-末端 * * DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分 子形式。表现为生物体不同遗传信息。造 成物种的多样性。 生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。 * 二、DNA的二级结构 双螺旋结构的主要依据： 1、X射线衍射数据：DNA中含有2或以上具有螺旋结构的多核苷酸链，且具有0.34nm和3.4nm的周期变化。 2、碱基成对：Chargaff规则 3、电位滴定法：游离碱基可滴定，而碱基对不能，碱基以氢键相连。 双螺旋结构模型是WatsonCrick于1953年提出的。 * 双螺旋结构模型的要点 1、B-型双螺旋结构 由两条反相的平行多核苷酸链构成（5’-端与3’-端相对）绕分子轴向上盘旋的右手螺旋。 主链位于双螺旋的外侧，主链亲水 碱基位于双螺旋的内侧，一条链上碱基上的-NH2与另一条链上碱基上的O或N以氢键配对，且配对总发生在A=T间，C≡G间。碱基互补 每个平面上由两个碱基形成碱基对(base pairing, bp)。相邻碱基平面在螺旋轴之间的距离为0.34nm 旋转夹角为36°，沿中心轴每旋转一周有10个核苷酸，双螺旋结构的直径2nm，螺圈10个碱基对平面，螺距3.4nm。 双螺旋的链之间沿中心轴形成大沟(major groove)和小沟(minor groove)交替出现。 * 2.0 nm 小沟 大沟 * B-型结构 两条链反向平行，右手螺旋 碱基在内（A＝T，G≡C） 碱基平面垂直于螺旋轴 戊糖在外，双螺旋每转一周 为10碱基对（bp） A-型结构 碱基平面倾斜20o，螺旋变 粗变短，螺距2～3nm。 Z-型结构 磷酸基在多核苷酸骨架上呈 锯齿状排列，左手螺旋，只 有小沟 * DNA的锂盐在相对湿度44%~46%下为另一种结构类型，C-DNA。 螺距3.09nm，每转螺旋含9.33个碱基对，碱基对倾斜6°。 DNA在A、T序列交替的区域时结构类型为D-DNA。（噬菌体Ｔ２的DNA 在相对湿度达到60％时，结构类似D-DNA ） 螺距2.43nm，每转螺旋含8个碱基对，碱基对倾斜16°。 * 双螺旋结构模型的不同点 直径不同 螺圈螺距不同 碱基对数量不同 碱基对平面与分子轴交叉角度不同 * A-，B-，Z-, C-, D-DNA的特性比较 类型 旋转方向 螺旋直径（nm） 螺距（nm） 每转碱基对数目 碱基对间垂直距离（nm） 碱基对与水平面倾角 A－DNA B－DNA Z－DNA C－DN