虹鳟鱼ndk-1 基因cdna 的克隆与序列特征分析 - core.pdfVIP

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2017-09-02 发布于天津
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虹鳟鱼ndk-1 基因cdna 的克隆与序列特征分析 - core

华北农学报·2009, 24 (4):70-73 虹鳟鱼NDK -1 基因cDNA 的克隆与序列特征分析 1 2 1 3 1 1 1,4 王家庆,刘晓慧,李代宗,韩进诚,郭　冉 ,王岳鸿,王志平 (1.河北农业大学海洋学院, 河北秦皇岛　066003;2.厦门大学生命科学学院, 福建厦门　361005; 3.商丘师范学院河南商丘　476000;4.渭南师范学院, 陕西渭南　714000) 　　摘要:以虹鳟鱼(Oncorhynch us mykiss )为研究材料, 使用RT-PCR 和RACE 法分离和克隆了虹鳟鱼NDK -1 基因cDNA 的全长序列(GenBank登录号:(FJ607868)。序列全长953 bp, 其中5′端非翻译区(5′-UTR)长 45 bp, 3′端非翻译区(3′- UTR)长284 bp, 开放性阅读框(ORF)长624 bp, 编码207个氨基酸。虹鳟鱼NDP 蛋白序列与几种脊椎动物台湾樱花钩吻鲑、斑马鱼、西方爪蟾、非洲爪蟾、人和黑青斑河的同源性分别为95%,72%, 68%, 68%, 65%和 64%, 表明NDK -1 基因在进化过程中是高度保守的。关键词:虹鳟鱼;NDK -1 基因;RT-PCR;RACE 中图分类号:S917　　文献标识码:A　　文章编号:1000-7091(2009)04-0070-04 The Cloning and Analysis of NDK -1 cDNA Derived from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss ) 1 2 1 3 WANG Jia-qing , LIU Xiao-hui , LI Dai-zong , HAN Jin-cheng , 1 1 1, 4 GUO Ran ,WANG Yue-hong ,WANG Zhi-ping (1.College of Ocean,Hebei Agricultural University,Qinhuangdao　066003,China;2.College of Life Sciences,Xiamen University,Xiamen 　361012,China;3.Shangqiu Normal University, Shangqiu 　476000,China;4.Weinan Normal University,Weinan　714000,China) Abstract:RT-PCR and RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)methodswere used for the isolation of the full- length cDNA of NDK -1 gene (GenBank accession number:FJ591154)from rainbow trout.Sequence analysis revealed a 953 bp cDNA containing the 45 bp 5′-UTR,284 bp 3′-UTR and 624 bp ORF encoding 207 amino acids.Sequence align- ment of NDP amino acid between rainbow trout and salmon,zebrafish,western frog,africafrog,human and fugu exhibited 95%,72%, 68%,68%,65%and 64%identity r