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蛋白质结构的水平
(一)结构层次:
1 一级结构(primary structure)
2 二级结构(secondary structure)
3 超二级结构(supersecondary structure)
4 结构域(structural domain)
5 三级结构(tertiary structure)
6 四级结构(quaternary structure); 1 一级结构:多肽链共价主链的氨基酸顺序。
2 二级结构:由多肽链主链骨架的折叠构象。
3 超二级结构:二级结构单元相互聚集,形成更
高一级的有规律的结构。
标准折叠单位(standard folding unit)或
折叠花式(folding motif);4 结构域: 多肽链在二级结构或超二级结构的基础
上形成三级结构的局部折叠区,它是相
对独立的紧密球状实体。
5 三级结构:多肽链通过盘旋、折叠,形成紧密的
借各种次级键维持的球状构象。是蛋白
质分子或亚基内所有原子的空间排布。
6 四级结构:寡聚蛋白质中亚基的种类、数目??空
间排布以及亚基之间的相互作用。
;1 肽平面(peptide plane)
2 二面角:
N–C?(?)和C?–C(?)都是单键,可以绕键轴自由旋转(Pro除外),其旋转角度分别用?和?表示,称为二面角(dihedral angle);非键合原子间的
最小接触距离 (允许距离,极限距离)
允许区(7.7%)
部分允许区(13%)
不允许区(~80%)
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