海洋微生物与噬菌体间的相互关系 - 厦门大学学术典藏库.pdf

2011 年 第 56 卷 第 14 期： 1071 ~ 1079 《中国科学》杂志社 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 海洋微生物与噬菌体间的相互关系 ①② ②③ ①* ②* 张永雨 , 黄春晓 , 杨军 , 焦念志 ① 中国科学院城市环境研究所城市生态健康与安全重点实验室, 厦门 361021; ② 厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室, 厦门 361005; ③ 福建省厦门第一中学, 厦门 361003 * 联系人, E-mail: jyang@; jiao@ 2010-12-23 收稿, 2011-03-30 接受 国家自然科学基金、近海海洋环境科学国家重点实验室(厦门大学)青年访问学者基金(MELRS0932)和福建 省科技计划重点项目(2009Y0044)资助 摘要 病毒是海洋中丰度最高的生物体, 其中绝大多数又为能够侵染细菌和古菌的噬菌体. 关键词 它们在控制微生物死亡率、调节微生物群落结构与多样性、影响微食物网过程以及参与碳、 海洋噬菌体 氮等元素的生物地球化学循环等方面扮演着重要的生态角色. 本文对近年来关于海洋细菌 噬菌体感染 与其病毒间相互关系的研究进行了概述, 并结合作者的工作对未来的研究进行展望. 水平基因转移 噬菌体抗性 海洋病毒学是当今海洋生态学研究的前沿热点 噬菌体侵染细菌的实验证明了DNA 是生命的遗传物 之一[1], 而病毒与细菌间的相互关系是其中一个很重 质, 并进而推动了一门全新学科即分子生物学的问 要的研究方面. 病毒在海洋生态系统中是数量最多、 世[2]. 然而关于海洋噬菌体的研究却起步较晚. 直到 遗传多样性最高的生物体, 而且其中绝大多数为噬 20 世纪 90 年代, 人们通过电子显微镜观察才发现海 菌体. 它们是引起微生物死亡的最主要因素之一. 通 水中含有大量的病毒粒子, 且其中主要为噬菌体[3]. 过噬菌体感染、水平基因转移以及诱导宿主微生物产 使得噬菌体在海洋生态系统中的潜在生态功能开始 生抗性突变等方式, 在调节微生物种群大小、结构与 引起人们的广泛关注. 多样性以及影响微食物网过程, 参与碳、氮等元素的 研究表明, 噬菌体在海洋中的数量极其丰富, 总 生物地球化学循环等方面起着重要作用. 量约1030 个. 著名的海洋病毒学专家Suttle[4] 曾就这个 本文将综述海洋噬菌体与细菌间相互关系研究 庞大数量打了一个形象的比喻: “如果将海洋中的病毒 的进展, 进一步阐明噬菌体在海洋生态系统中的重 头尾相连排成一列, 那么这个队列的长度将比地球附 要生态地位与功能. 近的 60 个星系相互间的距离总和还要长”. 噬菌体在 海洋中无处不在, 可以说哪里有微生物出现, 哪里就 1 海洋噬菌体的发现及其丰度大小 会伴有噬菌体的存在. 在表层海水中噬菌体的丰度约 噬菌体是一种以原核生物(包括细菌和古菌等) 7 [3] 为 10 个/mL, 是细菌丰度的5~25 倍 . 虽然, 随着海 为宿主的病毒类群, 它最早发现于 1915 年. 之后, 水深度的增加, 病毒的数量有逐渐减少的趋势. 但在 d’Herelle 在 1917 年又再次发现