福氏痢疾杆菌组氨酸合成中双功能焦磷酸水解酶和磷酸核糖环化水解 .pdf

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福氏痢疾杆菌组氨酸合成中双功能焦磷酸水解酶和磷酸核糖环化水解

中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2009,29(4):56~60 福氏痢疾杆菌组氨酸合成中双功能焦磷酸水解酶和 磷酸核糖环化水解酶双功能蛋白的初步研究 1 2 1 1 1 2 2 陆庆宇  王其海  张占钰  袁道鹏  高 伟  仓怀兴  毕汝昌 (1北京林业大学理学院 北京 100083 2中国科学院生物物理所 北京 100101) 摘要 福志贺氏菌属是一类革兰氏阴性杆菌,是引起人类细菌性痢疾的主要致病源。以福志贺 氏痢疾杆菌2a型301株全基因组为模板、以pET22b(+)为载体、克隆了一个关键基因:组氨酸 合成途径中双功能焦磷酸水解酶和磷酸核糖环化水解酶蛋白(简称:sf2088)。以BL21(DE3)为 表达菌株,优化表达条件,获得了可溶表达的蛋白。经过亲和层析和分子筛层析获得目标蛋白。 采用分析超速离心和动态光散射实验,对纯化后的蛋白进行稳定聚集状态的条件搜索,结果发现 锌离子对稳定其聚合状态很重要。通过正交实验,获得蛋白保持稳定聚集态的条件。这对该酶 的进一步研究奠定了基础。 关键词 组氨酸合成途径 双功能蛋白 PRATP焦磷酸水解酶 PRAMP解环酶 表达与纯化 中图分类号 Q819   在氮元素合成代谢通路中,组氨酸生物合成与其 于组氨酸是唯一的一个其碳架结构来自于核苷的氨基 [1] 酸[7]。研究此蛋白酶的功能能为研究致病菌痢疾杆菌 前体和中间产物的转化有着很重要的关联 。其合成 通路共有11步化学反应,8个结构基因参与编码合成 的生理功能提供依据,为将来生物制药提供一定的理 通路中反应所需要的催化酶[1,3,4]。在合成通路中,ATP 论基础[8~10]。 作为底物,先是糖基化,然后是被 HisE蛋 白: 1 材料与方法 phosphoribosylATPpyrophosphatase(PRAPH)的去焦磷 酸化作用,接着是由 HisI基因编码的环化水解酶: 1.1 材 料 phosphoribosylAMPcyclohydrolase(PRACH)的开环反   Sf2088基因扩增引物由上海申能博彩公司合成。 应。在这两步关键的转换过程中,AMP上的一个氮和 限制性内切酶Nde /Xho 、DNAligationkit、TaqDNA Ⅰ Ⅰ 碳被传递到组氨酸的咪唑环上。具体来说,PRAMP环 聚合酶,DL2000Marker,均购自TaKaRa生物工程公司。 化水解酶水解PRAMP上的腺嘌呤环,作用位点在N1 质粒提取和胶回收试剂盒均购 自博大泰克公司。 pET22b质粒、E.coliDH5、E.coliBL21(DE3)菌株由 和C6之间,这样腺嘌呤继而在腺嘌呤脱氨酶催化下脱 α 下了氨基。这两个酶催化有一共同特征,即都在溶液 本实验室保存。 [5]   蛋白质晶体生长试剂盒 CrystalScreensIandII和 中存在游离锌离子作亲核攻击实现脱氨作用的 。研 究表明PRAMP环化水解酶的活性依赖锌离子存在, IndexScreen购自HamptonResearch公司。 因此被命名为金属酶[6]。而在有些微生物如痢疾杆菌 1.2 方 法 中,这两步反应可以依靠一个双功能酶 HisIE,即同时 1.2.1 PCR扩增 根据测定的sf301菌株的全基因组 拥有 HisI和HisE两种酶在反应中的作用来实现。由 序列设计引物,序列如下:   F:5′GGAATTCACTCG

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