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糖命名
九、糖的命名
单糖可以分为醛糖(aldose)和酮糖(ketose)两大类,含有醛基的单糖称为醛糖,含有酮基的单糖称为酮糖。然后再根据分子中碳原子数目分别称为丙醛糖,丙酮糖、丁醛糖、丁酮糖……等。例如:
单糖的链型结构常用Fischer投影式来表示。下面以D-(+)-葡萄糖为例来予以说明。
D-(+)-葡萄糖的费歇尔投影式
用费歇尔投影式表示时规定:糖中的羰基必须位于投影式的上端,碳原子的编号从靠近羰基的一端开始。如上面的式(i);为了书写方便,也可以将手性碳上的氢省去,如式(ii);更方便的方法是将手性碳上的羟基、氢及碳氢键均省去,如式(iii)。若将(iii)中的醛基用△表示,羟甲基用○表示,则得到式(iv),这是最简单的写法。上面所述的四种表示方法中,(iii)式是应用最广的。
单糖可以分为D型系列和L型系列。两个系列的划分是以甘油醛(glyceric aldehyde)的结构作为比较标准,并根据Fischer投影式中最下面的一个不对称碳原子的构型决定的。若该手性碳原子的构型与D-甘油醛的结构相同,则属于D系列。若与L-甘油醛的结构相同,则属于L系列。例如:
单糖可以按系统命名法来命名,但由于单糖分子中常有多个手性碳原子,立体异构体很多,为方便起见,普遍以它的来源来命名。糖的旋光方向是由实验测知的,右旋为“+”,左旋为“-”。例如:
下面列出了3~6个碳原子的D型系列的醛型单糖及其普通名称。
下面是葡萄糖的环型结构和名称:
下面是D-果糖的呋喃型结构和名称:
下面是四个双糖的结构和名称:
十 氨基酸和多肽的命名
1氨基酸的命名
羧酸分子中烃基上的一个或几个氢原子被氨基取代后生成的化合物称为氨基酸。根据氨基和羧基的相对位置,氨基酸可以分为a-氨基酸、b-氨基酸、g-氨基酸等。根据氨基酸分子中羧基与氨基的相对数目,氨基酸可以分为中性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸。组成蛋白质的氨基酸主要是a-氨基酸,可用通式RCH(NH2)COOH表示。从通式不难看出,除R = H外,a-氨基酸中的a碳原子都是手性碳原子。a-氨基酸中的手性碳原子可以用R、S构型法标记,但与糖一样,更习惯用D、L构型法标记。D或L也是以甘油醛为标准来确定的,将a-氨基酸用Fischer投影式表示,羧基写在竖线的上方,R基写在竖线的下方,氨基和氢写在横线的两侧,若氨基的位置与L-甘油醛中羟基的位置一致,就定义是L-氨基酸,与D-甘油醛中羟基的位置一致,就定义为D-氨基酸。天然的氨基酸多数是L-构型的。
氨基酸可以按IUPAC命名原则来命名,但为了方便,氨基酸的名称一般都用俗名,此外,每个氨基酸还都有一个缩写符号,作为这个氨基酸的代号。下表列出了各种氨基酸的结构、名称、缩写符号以及它们的物理性质。
2 多肽的命名
一个氨基酸的羧基与另一分子氨基酸的氨基通过失水反应,形成一个酰氨键,新生成的化合物称为肽(peptide),肽分子中的酰氨键叫做肽键(peptide bond)。二分子氨基酸失水形成的肽叫二肽,多个氨基酸失水形成的肽叫多肽(polypeptide)。例如下面是两个甘氨酸失水形成一个二肽(dipeptide),肽也是以两性离子的形式存在的。
在多肽化合物中,通常把保留羧基的一端称为C—端,保留氨基的一端称为N端,书写时,习惯将C—端写在右边,N—端写在左边。命名多肽化合物,令C—端的氨基酸为母体,肽链中的其它氨基酸看作是酰基取代基,放在母体前。酰基的排列顺序是从N—端开始,依次往下,母体名称和各酰基名称之间用一短线分开。例如下面是一个三肽
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