蛋白质组学临床实验及应用.docVIP

蛋白质组学临床实验及应用临床蛋白质组学的研究是一个广阔的全新领域，它有许多潜在的应用性，包括生物标记物的鉴定识别和疾病的监测方面，尤其是在肿瘤学方面，其前景非常好。表达蛋白质组学通过特殊的基因来评价分析细胞蛋白质译成密码的产生过程。表达蛋白质组学探究健康和疾病状态蛋白质有差别的表达及翻译后修饰。这些生物标记物可能应用于疾病的早期诊断、预后和治疗反应的预测。功能蛋白质组学寻找新的分子疗法来解开疾病生物学中蛋白质-蛋白质的相互作用和相关生物化学途径及要达到的目标。先进的光谱法以及新的蛋白质排列模式已经完善了这些分析，而且被运用于临床实验中。不断发展的蛋白质组学技术能够引导一个个性化分子医学时代，使疾病在早期发展阶段被诊断出来，由于患者的恶性蛋白质表达被剪除从而使治疗更为有效。? 在以前关于疾病的分子学基础的研究探索中，基因组成为人们最初探索研究的焦点。基因中编码的信息被转录进mRNA，然后进一步加工、处理、修饰连接，从而用很少的原材料就可以产生众多与原来基因材料相同的蛋白质。蛋白质组包括所有来源于个体完整基因遗传密码的蛋白质。蛋白质组学在基因组中编码了什么和蛋白质中翻译了什么之间架起了联系的桥梁。和核酸相比，蛋白质更能代表细胞的功能产量。蛋白质因此反映了细胞的真实情况，而且不同的蛋白质表达可以帮助在疾病状态中界定健康状态[1]。? 对一个已给定细胞的全部或有选择性的蛋白质表达的蛋白质组特点进行研究能够描述蛋白质组中的一系列信息[2]。据估计，人类蛋白质组由超过50万个蛋白质组成，而这些蛋白质起源于人类基因组中的35 000个基因[3-4]。与单独研究基因相比，蛋白质组更具复杂性和潜在的特异性。对蛋白质组进行的相关研究一般可以分为两类：①阐述蛋白质表达；②阐述蛋白质功能。? 表达蛋白质组通过细胞中的活动基因和存在于靶器官中的基因来评价细胞的蛋白质产量。它揭露了健康状态和疾病状态两者间有差别的蛋白质表达。表达蛋白质组相关技术的应用使得能够通过包括组织、血清、尿和腹水在内的多种途径来研究蛋白质的表达。研究蛋白质组的最常用的技术包括2DE、质谱以及其他形式的光谱测定法与MALDI、SELDI的联合应用和其他技术平台。? 表达蛋白质组学已经被用于发现和确认疾病的生物标记物。生物标记物可以分为三个主类：诊断生物标记物、预后生物标记物、预测生物标记物。诊断生物标记物可以帮助传统的医学逻辑方法诊断疾病，尤其是倘若肿瘤已发生了转移而且肿瘤的最初来源又不能确定时。虽然有效的诊断标记物可以有助于癌症的早期发现从而减少介入诊断过程的需要，但是已有的真正的诊断生物标记物却是很少。β-人绒毛膜促性腺激素作为一个诊断是否怀孕的生物标记物早已被应用于实践；另外比如用于鉴别前列腺癌的前列腺特异抗原(PSA)或者鉴别卵巢癌的CA-125的灵敏度和特异度较低一些。预后的标记物，如激素受体，血管病标记物和增殖繁殖标记物可以提供关于疾病的可能临床起因或者恶化情况的信息，也可以指导治疗计划方案的制定[5-6]。最终预测标记物能够预言疾病的起因和最佳治疗方案。例如，乳腺癌的表达雌激素受体，最好用抗雌激素如他莫西芬或者芳香酶抑制剂[7-8]。? 功能蛋白质组评价蛋白质之间交互作用的活化状态，而且能够被用来绘制某细胞内众多的信息表示途经网的形态图。阐明蛋白质-蛋白质的相互作用是非常有用的。新发现的相互作用可以帮助寻找癌症中新的蛋白质和新的致癌基因，或者为共同的下游事件由两个不同的信息网共享来提供证据。更多的关于众多路径交叉的信息能够帮助针对这些路径进行直接干预治疗的发展[9]。功能蛋白质组利用MALDI/SELEI技术以及与新的蛋白质组织微观陈列的连合应用。? 基因组学领域关注的是对每个蛋白质核甘酸密码的描绘，但是每个蛋白质的基因密码并不是对蛋白质功能的完全预言。在它们所处的微环境中，当细胞受复杂的通信传递系统的影响时，多种体内因子就能够改变活动水平或蛋白质功能。蛋白质-蛋白质相互作用、翻译后修饰以及蛋白质和DNA或者RNA之间的交互作用都可能改变蛋白质的活性，而这些通过它的转录水平能够被预测。功能蛋白质组学在细胞的微环境中研究蛋白质的相互作用，从而决定了一个蛋白质如何完成它特异的细胞工作。对功能蛋白质组学的展望是：以疾病支撑蛋白结构为基础，通过对超离常规或高表达蛋白质的研究，能够达到治疗癌症的目的。另外，蛋白质分子靶向疗法的反应可以用来帮助监测靶向疗法的功效和寻找利用相同蛋白质途径进行治疗的其他潜在的可行方法。? 靶向分子的发现-尽管很多靶向药物的靶点是蛋白质，在被设想用靶向药物作用的超过3000个蛋白质中只有500个白质已经运用了靶向治疗方法[10]。对蛋白质组学的研究可以识别新的靶子，也可以帮助对已知药物的深入研究，许多小分子体外实