分子生物学知识框架.doc

分子生物学 结构分子生物学部分 绪论 ①总述：进化论、细胞学说、生化遗传学、DNA的发现 ②分子生物学：定义、研究内容（四方面） ③发展史：里程碑 ④三个相关学科：生物化学、细胞生物学、遗传学 ⑤中心法则：经典、现代 Ⅰ DNA ①结构：碱基比率、配对规则、种数(4n)、0.34nm的应用(碱基对M/2x,长度0.34×M/2x) ⑴三类DNA（ABZ）：结构、形成、特点及Z-DNA的作用 ⑵质粒超螺旋：正负超螺旋定义、转化、意义、计算、主要以负超螺旋存在 ⑶其它：0.34nm的计算、※DNA稳定因素（PO43-）与Tm、Z-DNA不稳 ②性质 ⑴复性：五条件、机制（Cot曲线）、三个吸光度 ⑵修饰：甲基化（ACG） ⑶变性：DNA碱性全变性、90OC以上全变性增色37%、增色效应（Tm） ⑷水解：酸（PH1,=4,甲基化DNA酸水解用处）；碱（RNA PH:13,11,DNA去碱基易） 酶（内切、外切） ⑸DNA稳定因素：对应核苷酸的P同电相斥、Na+、Tm ⑹分子伴侣：作用、分类（热休克蛋白、伴侣素）、作用机理（四条） Ⅱ tRNA ①形成：转录成三类，3‘去尾，5’斩头，化学修饰成稀有碱基（I、ψ） ②二级结构：四个臂（受体臂、反密码子臂、D臂、TψC臂），多余臂（2类）， tRNA长度决定因素（D臂、多余臂） ③三级结构：特点、二三级氢键、两个双螺旋、转折处（）、两端点（） 受体臂与反密码子臂距离远及原因 ④功能：转运氨基酸（受体臂3‘-CCA）、解读密码子（反密码子臂） ⑤种类：tRNAi/tRNAe（起始/延伸）,同工tRNA（定义）tRNA性质由反密码子决定 Ⅲ 核糖体 ①核糖体的细胞学知识：见细胞生物学 ②三个位点：A、P、E作用 ③原核30S小亚基上16SrRNA反SD序列：结构（3ˊ富含嘧啶区GAUCACCUCCUUA）、作用 Ⅳ mRNA ①真原核比较：帽、尾、单多顺反子、起始密码子个数原核有三个起始密码子 （AUGGUGUUG）—RNP ⑵真核：三个水平（细胞周期、染色体、复制子） Ⅱ DNA损伤与修复 ①损伤：三种（紫外线、脱氨、甲基化、氧化机制，对应修复法）：碱基异常（U-G、T-G） ②变异：基因突变基础、突变类型、突变后果 ③修复：切除（碱基、核苷酸），错配（Dam、5‘GATC3’）—乳糖操纵子学说 ⑴操纵子结构：PI…POZYA、I、O、Z、Y、A作用 ⑵核心思想：I编码阻遏蛋白与O结合，阻碍ZYA三基因表达；ZYA编码三种酶，用于消化乳糖 ※Z、Y、A对应的三种酶及功能：Z-β半乳糖苷异构酶；Y-β半乳糖苷透过酶；A-β半乳糖 苷乙酰基转移酶 ⑶只有乳糖时：乳糖在Z酶催化下成异构乳糖，异构乳糖在Y酶催化下进入基因组，与O区上的阻遏蛋白结合，使阻遏蛋白脱离O区，使ZYA可表达 ※异构乳糖是效应物 ※两个矛盾：定义、解释（阻遏蛋白与O区非共价结合，不稳） ⑷有葡萄糖、乳糖时（代谢产物阻遏作用）：虽然可通过上述机理使阻遏蛋白脱离O区，但葡萄糖分解产物可与O结合，阻碍ZYA表达 ※降解物敏感型操纵子：定义 ⑸CAMP-CRP调控：CAMP定义；正调控机理；抗解链蛋白的阻遏 ②转录终止水平的调控—色氨酸操纵子学说 ⑴细菌SOS应急反应： ⑵弱化作用：弱化子结构（前导区，10、11位为色氨酸密码子，表达出前导肽） ※转录的弱化作用：作用于前导肽的翻译合成过程 前导肽合成受tRNATrp影响：10、11位为色氨酸密码子，翻译过程中，色氨酸浓度影响核糖体在mRNA上的移动速度（见下） 当色氨酸少时：tRNATrp少→核糖体在10、11位移动速度小→4区转录完后，核糖体到1区（10、11位之间）→2区与3区配对→继续转录色氨酸操纵子，自己继续合 成色氨酸 当色氨酸多时：核糖体在10、11位移动速度快→4区转录前，核糖体已到2区→2区与3区不能配对→3区与4区配对成茎环终止结构→色氨酸操纵子转录停止→不自己继续合成色氨酸 ⑶安慰性诱导物：定义、举例 ⑷魔斑：定义、产生原因 ③翻译水平的调控 ⑴反义RNA的调控：阻碍核糖体与mRNA结合 ⑵调节蛋白的调控：竞争mRNA的核糖体结合位点 Ⅲ 真核基因调控 ①染色质水平调控 ⑴转录活跃区结构变化的调控： ⑵甲基化调控： ⑶组蛋白乙酰化调控： ②转录水平的调控 ⑴转录因子DNA结合域： ⑵转录因子转录激活域： ③转录后加工：见转录 ④翻译水平调控： ⑴mRNA稳定性因素：5‘帽，3‘尾，去稳定元件，SiRNA（小干扰RNA，双链，特异降解mRNA） ⑵翻译起始的调控： ⑤翻译后水平加工：见翻译